More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0899 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  100 
 
 
248 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  36.68 
 
 
311 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  33.47 
 
 
307 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  34.53 
 
 
558 aa  105  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  29.92 
 
 
322 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  27.23 
 
 
308 aa  102  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  34.58 
 
 
502 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  39.29 
 
 
516 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  30.97 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  31.13 
 
 
541 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  29.6 
 
 
284 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  39.44 
 
 
551 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  31.65 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  33.58 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  27.89 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  30 
 
 
281 aa  88.6  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  30.62 
 
 
533 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  32.13 
 
 
490 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  33.06 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  28.75 
 
 
544 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  28.74 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  30.73 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  36.11 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  29.73 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  27.78 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  29.73 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  28.14 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  30.63 
 
 
551 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  27.32 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  30.14 
 
 
551 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  30.94 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  29.01 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  30.43 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  30.97 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  27.23 
 
 
271 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  27.46 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  27.27 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  27.45 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  29.01 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  29.19 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  27.67 
 
 
510 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  28.41 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  29 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  28.41 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  29.08 
 
 
516 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  31.97 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  31.01 
 
 
514 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  29.96 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  30.61 
 
 
514 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  33.64 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  29.96 
 
 
514 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  30.24 
 
 
517 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  28.5 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  31.16 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  29.57 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  26.8 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  26.8 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  36.84 
 
 
735 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  28.23 
 
 
517 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  26.42 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  28.76 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  29.69 
 
 
514 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  33.78 
 
 
500 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  27.67 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  27.91 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  25.6 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  29.53 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  29.55 
 
 
316 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  29.41 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  29.29 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  27.97 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  29.66 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  27.56 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  28.29 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  29.93 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  24.82 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  27.91 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  32.14 
 
 
310 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  30.77 
 
 
326 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  28.38 
 
 
306 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  24.64 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  28.78 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  27.56 
 
 
607 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  25.87 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  25.91 
 
 
287 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  26.14 
 
 
251 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  28.12 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  27.93 
 
 
264 aa  62.4  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  27.93 
 
 
264 aa  62.4  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  29.46 
 
 
255 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0901  hypothetical protein  30.91 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  30.77 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  30.77 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  30.77 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  30.89 
 
 
517 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  33.88 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  28.96 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  27.27 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  27.27 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  35.29 
 
 
752 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>