73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1738 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1738  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 
276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  28.57 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  27.41 
 
 
311 aa  62.4  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  23.53 
 
 
247 aa  62.4  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  25.49 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  22.51 
 
 
308 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  25.57 
 
 
541 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  29.71 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  25.16 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  25.16 
 
 
247 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  25.16 
 
 
247 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  23.9 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  23.9 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  23.9 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  23.9 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  30.11 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  23.9 
 
 
247 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  30.56 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  28.4 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  22.03 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  27.84 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  26.88 
 
 
334 aa  52  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  22.17 
 
 
558 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  24.53 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  26.69 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  23.9 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.98 
 
 
533 aa  48.9  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  30.37 
 
 
306 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2384  spermidine synthase-like protein  29.01 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  25.17 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  25.17 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  24.52 
 
 
261 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  25.97 
 
 
286 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  28.04 
 
 
277 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.1 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  27.22 
 
 
287 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0901  hypothetical protein  23.75 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  35.04 
 
 
309 aa  45.8  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  24.6 
 
 
284 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  27.22 
 
 
257 aa  45.4  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  24.6 
 
 
276 aa  45.4  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  27.87 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  28.81 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  25.65 
 
 
551 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  23.46 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  24.6 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  28.81 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  28.81 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  28.81 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  24.56 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  26.11 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  27.87 
 
 
387 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  22.97 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  25.76 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  25.48 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  27.87 
 
 
398 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0791  spermine synthase  23.26 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0618517 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0828  spermine synthase  26.11 
 
 
247 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547147 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  27.87 
 
 
387 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  28.12 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  23.33 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  24.67 
 
 
289 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  27.27 
 
 
287 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  25 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  24.3 
 
 
339 aa  43.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  28.82 
 
 
322 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  27.34 
 
 
251 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  27.27 
 
 
305 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  26.62 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  26.09 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  25.79 
 
 
278 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  25.9 
 
 
305 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  26.62 
 
 
283 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>