243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0321 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  100 
 
 		 264 aa  549  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  65.47 
 
 		 235 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  65.47 
 
 		 235 aa  310  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  46.47 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  46.38 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  46.28 
 
 		 278 aa  208  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  45.53 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  47.23 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  47.44 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  47.23 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  45.12 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  48.6 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  47.67 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  42.98 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  42.55 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  45.5 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  37.71 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  38.11 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  44.04 
 
 		 281 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  40.6 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  37.6 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  43.06 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  37.82 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  39.15 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  39.15 
 
 		 278 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  40.64 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  41.55 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  33.48 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  34.93 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  36.98 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  31 
 
 		 256 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  31.56 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  32.24 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  26.91 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  26.91 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  26.91 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  26.91 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  26.51 
 
 		 398 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  26.51 
 
 		 387 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  32.08 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  26.51 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  27.31 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  31.13 
 
 		 305 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  29.57 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  33.85 
 
 		 322 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  31.37 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  32.64 
 
 		 310 aa  95.5  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  31.37 
 
 		 251 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  33.16 
 
 		 315 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  30.97 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  28.91 
 
 		 305 aa  92  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  25.59 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  28.31 
 
 		 310 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  28.44 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  28.44 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  28.44 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  28.44 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  28.31 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  28.44 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  28.87 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  29.28 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  28.88 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  31.47 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  26.48 
 
 		 308 aa  85.5  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  30.69 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  27.63 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  27.31 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  29 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  31.77 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  30.61 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  30.27 
 
 		 255 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  31.38 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  29.85 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  29.85 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  30.28 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  30.46 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  30.48 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0502  hypothetical protein  28.95 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  28.44 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  28.89 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  29.11 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  28.89 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  29.03 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  29.03 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  28.04 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  29.2 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  29.2 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  28.39 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  30.11 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  25.35 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  33.75 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  28.66 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  26.71 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  28.12 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.93 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  26.58 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  27.44 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.76 
 
 		 558 aa  62.4  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  26.58 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>