87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2075 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 287 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  54.58 
 
 		 281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  57.89 
 
 		 273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  50.56 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  48.21 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  47.18 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  50.38 
 
 		 276 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  45.49 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  45.71 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  43.73 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  44.66 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  45.53 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  43.77 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  42.38 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  41.6 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  40.65 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  35.59 
 
 		 316 aa  178  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  46.43 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  41.45 
 
 		 516 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  42.28 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  39.92 
 
 		 500 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  40.09 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  41.67 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  42.27 
 
 		 514 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  42.99 
 
 		 492 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  42.27 
 
 		 514 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  40.15 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  41.24 
 
 		 514 aa  155  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  44.71 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  37.55 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  41.75 
 
 		 514 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  40.72 
 
 		 514 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  37.76 
 
 		 517 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  45.16 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  35.42 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  38.8 
 
 		 517 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  35.08 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  40.99 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  38.99 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  35.27 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  36.32 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  37.07 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  37.12 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  30.51 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.26 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  27.82 
 
 		 533 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  27.84 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  30.06 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.76 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  30.06 
 
 		 705 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  25 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  32.24 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  29.85 
 
 		 974 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  29.8 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  33.33 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  26.11 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  27.27 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  26.07 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  24.26 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  29.82 
 
 		 752 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  30.73 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  30.23 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  29.61 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.32 
 
 		 516 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  27.97 
 
 		 759 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  25.64 
 
 		 267 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  30.23 
 
 		 759 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  29.38 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  33.03 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  28.91 
 
 		 759 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  28.87 
 
 		 502 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  26.28 
 
 		 490 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  29.73 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  32.14 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  26.67 
 
 		 551 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0218  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  31.88 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1738  Spermidine synthase-like protein  27.27 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  27.15 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  24.6 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  27.85 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  28.82 
 
 		 824 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  24.53 
 
 		 551 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  28.68 
 
 		 678 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  25.78 
 
 		 544 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  26.97 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  26.85 
 
 		 328 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>