26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44275 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  100 
 
 		 824 aa  1692    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  30.64 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  28.92 
 
 		 289 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  33.04 
 
 		 259 aa  53.9  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  26.03 
 
 		 271 aa  52  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  29.19 
 
 		 280 aa  52  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  24.1 
 
 		 276 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  24.1 
 
 		 284 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  25.13 
 
 		 269 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  27.27 
 
 		 255 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  28.38 
 
 		 231 aa  50.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  26.44 
 
 		 261 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  31.1 
 
 		 285 aa  49.7  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  30.23 
 
 		 287 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  30.49 
 
 		 285 aa  48.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  28.99 
 
 		 262 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  29.41 
 
 		 273 aa  47.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  27.68 
 
 		 316 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  30.12 
 
 		 310 aa  46.6  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  31.03 
 
 		 278 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  28.36 
 
 		 274 aa  45.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 304 aa  45.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  28.1 
 
 		 257 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  25.98 
 
 		 308 aa  44.3  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  28.31 
 
 		 271 aa  44.3  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>