257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0912 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  45.93 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  45.06 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  43.95 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  48.48 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  49.15 
 
 		 271 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  47.74 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  43.06 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  43.06 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  47.74 
 
 		 269 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  41.77 
 
 		 278 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  41.77 
 
 		 278 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  47.24 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  47.24 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  46.73 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  46.32 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  48.07 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  45.5 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  43.94 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  45.5 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  45.5 
 
 		 278 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  41.5 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  39.3 
 
 		 289 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  41.92 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  42.56 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  42.23 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  42.23 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  39.59 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  35.59 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  38.12 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  34.65 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  35.11 
 
 		 310 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  32.11 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  37.19 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  34.57 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  33 
 
 		 387 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  33 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  34 
 
 		 364 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  33 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  33 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  33 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  35.11 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  32.5 
 
 		 387 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  32.04 
 
 		 398 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  34.57 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  34.04 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  34.57 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  34.57 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  32.38 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  34.04 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  34.04 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  35.05 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  32.46 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  30.85 
 
 		 291 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  32.2 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  32.29 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  34.04 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  31.96 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  33.51 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  33.51 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  30.81 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  31.38 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  32.98 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  32.98 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  32.98 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  32.98 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  27.57 
 
 		 308 aa  85.1  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  30.61 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  26.05 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  37.72 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  32.83 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  33.07 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  25.87 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  30.34 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  32.28 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  28.99 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  30.91 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  31.65 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  29.75 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  30.3 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  30.3 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  31.01 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  29.7 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  30.91 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  29.69 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  31.65 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  31.01 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  28.29 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  36.61 
 
 		 490 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  27 
 
 		 322 aa  72  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  30.38 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  33.81 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  28.48 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  28.48 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  28.48 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  28.48 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  28.48 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  31.01 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  29.47 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  34.21 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>