145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1581 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  100 
 
 
304 aa  586  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  50.35 
 
 
304 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  44.97 
 
 
307 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  50.78 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  47.29 
 
 
310 aa  218  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  54.08 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  47.06 
 
 
287 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  43.8 
 
 
316 aa  202  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  46.09 
 
 
296 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  43.23 
 
 
285 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  37.63 
 
 
301 aa  181  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  41.73 
 
 
285 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  42.21 
 
 
315 aa  169  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  43.65 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  44.44 
 
 
287 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  41.86 
 
 
287 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  40.98 
 
 
332 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  43.35 
 
 
309 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  39.92 
 
 
273 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  36.7 
 
 
273 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  38.21 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  41.67 
 
 
284 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  34.83 
 
 
281 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  39.9 
 
 
268 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  38.14 
 
 
282 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  39.05 
 
 
500 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  35.91 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  36.97 
 
 
517 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  36.41 
 
 
271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  37.62 
 
 
517 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  33.07 
 
 
514 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  34.88 
 
 
514 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  33.95 
 
 
514 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  33.95 
 
 
514 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  34.12 
 
 
516 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  35.55 
 
 
492 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  37.07 
 
 
262 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  33.95 
 
 
514 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  33.61 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  32.86 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  36.14 
 
 
266 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  30.5 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  32.99 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  27.67 
 
 
558 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  37.5 
 
 
502 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  31.68 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  28.31 
 
 
311 aa  68.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  34.18 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  27.43 
 
 
551 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.74 
 
 
516 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  33.63 
 
 
475 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  28.49 
 
 
533 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  32.76 
 
 
251 aa  62.4  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  32 
 
 
248 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.77 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  30 
 
 
548 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  31.94 
 
 
551 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  32.04 
 
 
510 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  29.76 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  30.28 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  30.49 
 
 
551 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  28.19 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  33.11 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  28.35 
 
 
247 aa  56.6  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  32.52 
 
 
275 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  30.95 
 
 
974 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  35.4 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  22.52 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  30.13 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  26.88 
 
 
273 aa  53.5  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  28.35 
 
 
253 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  27.85 
 
 
541 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  30.19 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  28.03 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  28.03 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  25.58 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  26.88 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  31.62 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  25.58 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  25.58 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  31.43 
 
 
286 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  25.49 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  37.07 
 
 
312 aa  49.7  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  25 
 
 
247 aa  49.3  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  25 
 
 
247 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  27.78 
 
 
752 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  25 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  35.37 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  25.13 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  30.91 
 
 
824 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  25.56 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  35.37 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2629  hypothetical protein  36.61 
 
 
223 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  26.6 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_4846  predicted protein  29.41 
 
 
218 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291862  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  31.18 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  26.98 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  46.2  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  29.11 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  25.21 
 
 
247 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>