79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1190 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  36.73 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  31.3 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  34.18 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  29.58 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  29.87 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  31.31 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  29.17 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  32.17 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.12 
 
 		 490 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  27.33 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  25.58 
 
 		 607 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  31.65 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  29.69 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  31.21 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  29.44 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  31.45 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  30.83 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  25.39 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  24.02 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  28.66 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  24.02 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  27.27 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  27.43 
 
 		 510 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  25.29 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  29.08 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  25.28 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  26.95 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  31.86 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  26.32 
 
 		 551 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  29.32 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  28.8 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  28.26 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.5 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  27.27 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  26.99 
 
 		 533 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  28 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  26.82 
 
 		 255 aa  49.3  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  27.5 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  31.1 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  27.33 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  27.42 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  24.88 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  23.21 
 
 		 536 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  30.82 
 
 		 320 aa  47  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  23.81 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  24.65 
 
 		 517 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  31.58 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  24.55 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  25.68 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  27.17 
 
 		 544 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  24.04 
 
 		 492 aa  45.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  25.84 
 
 		 514 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3446  spermidine synthase  25.95 
 
 		 510 aa  45.8  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.351486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4094  spermidine synthase  25.95 
 
 		 521 aa  45.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392732  normal  0.362775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  25.66 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  23.76 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  25.91 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  26.67 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  24.55 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  25 
 
 		 514 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  28.47 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  21.17 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  26.57 
 
 		 522 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  30.51 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  26.28 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  27.03 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  26.4 
 
 		 514 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  25 
 
 		 514 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  22.34 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  22.73 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  32.38 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  25.29 
 
 		 502 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  25 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  25.81 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  23.53 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  27.03 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  26.77 
 
 		 517 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>