141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2336 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  87.63 
 
 		 310 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  76.29 
 
 		 291 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  74.91 
 
 		 295 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  75.26 
 
 		 291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  58.84 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  62.2 
 
 		 310 aa  331  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  59.04 
 
 		 305 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  56.39 
 
 		 305 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  56.39 
 
 		 305 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  56.39 
 
 		 305 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  58.67 
 
 		 387 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  56.39 
 
 		 305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  58.67 
 
 		 398 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  64.31 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  63.78 
 
 		 305 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  63.78 
 
 		 305 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  58.67 
 
 		 387 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  62.35 
 
 		 310 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  58.67 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  58.67 
 
 		 309 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  58.67 
 
 		 309 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  58.67 
 
 		 309 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  55.2 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  55.77 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  54.8 
 
 		 251 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  49.81 
 
 		 365 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  46.77 
 
 		 273 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  46.37 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  45.1 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  44.27 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  44.77 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  43.09 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  44.77 
 
 		 255 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  44.3 
 
 		 274 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  44.44 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  39.53 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  41.84 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  41.84 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  33.33 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  34.45 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  38.81 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  38.5 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  33.19 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  35.21 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  33.74 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  31.25 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  30.83 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  34.25 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  36.27 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  32.29 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  33.47 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  32.79 
 
 		 276 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  31.4 
 
 		 282 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  32.3 
 
 		 271 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  33.47 
 
 		 269 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  31.58 
 
 		 275 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  31.2 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  31.82 
 
 		 261 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  31.86 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  31.67 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  32.82 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  32.82 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  33.16 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  33.16 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  32.64 
 
 		 239 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  27.2 
 
 		 253 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  26.64 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  33.5 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  27.98 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  27.98 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  28.19 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  27.8 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  27.98 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  27.98 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  27.41 
 
 		 261 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  27.1 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  28.16 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  27.41 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  29.82 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  30.73 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  26.94 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  28.4 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  27.39 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  30.51 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  30.52 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  27.7 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  27.7 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  29.07 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  27.33 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  31.87 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  28.49 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  28.49 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  28.49 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  28.49 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  25.31 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  28.07 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  25.85 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.78 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>