149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0941 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  525  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  87.25 
 
 		 259 aa  474  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  55.38 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  54.8 
 
 		 315 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  54.58 
 
 		 291 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  54.8 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  52.59 
 
 		 295 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  52.21 
 
 		 305 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  52.61 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  52.61 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  52.61 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  52.61 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  52.61 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  51 
 
 		 310 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  55.08 
 
 		 305 aa  259  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  53.81 
 
 		 305 aa  259  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  54.24 
 
 		 387 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  54.24 
 
 		 364 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  54.24 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  54.24 
 
 		 398 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  54.24 
 
 		 309 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  54.24 
 
 		 309 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  54.24 
 
 		 309 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  54.24 
 
 		 309 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  50.2 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  43.14 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  42.55 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  40.85 
 
 		 260 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  40 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  41.77 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  40.16 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  40.85 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  39.92 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  39.92 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  39.83 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  39.27 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  34 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  36.48 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  38.03 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  34.16 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  37 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  32.89 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  37.19 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  34.95 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  32.5 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  34.67 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  33.04 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  30.71 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  32.81 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  32.29 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  35.15 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  32.35 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  33.33 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  33.51 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  31.37 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  33.51 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  32.82 
 
 		 282 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  31.37 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  32.11 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  32.11 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  31.61 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  31.61 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  32.84 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  34.02 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  34.38 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  34.38 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  34.38 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  33.17 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  25 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  33.9 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  27.78 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  27.78 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  27.78 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  32.74 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  25.27 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  28.71 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  28.99 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  31.41 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  32.93 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  26.6 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  33.54 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  28.24 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  28.24 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  28.24 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  28.57 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  25.1 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  31.37 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  24.76 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  29.49 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  30.06 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  27.88 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  30.06 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  27.88 
 
 		 261 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  27.96 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  29.34 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  27.88 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>