118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3414 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3414  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2748  hypothetical protein  99.6 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690701  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  88.45 
 
 		 254 aa  461  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  76.03 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  75.81 
 
 		 255 aa  391  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  78.33 
 
 		 274 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3215  hypothetical protein  67.77 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3240  hypothetical protein  65.75 
 
 		 255 aa  346  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  65.75 
 
 		 255 aa  343  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3059  spermidine synthase-like protein  53.1 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110993  normal  0.360599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  51.37 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  43.21 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  43.03 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  42.8 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  44.49 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  42.26 
 
 		 387 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  42.26 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  42.26 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  42.26 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  42.26 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  42.26 
 
 		 387 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  42.26 
 
 		 398 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  43.1 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  43.33 
 
 		 364 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  44.3 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  42.26 
 
 		 305 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  42.68 
 
 		 305 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  42.68 
 
 		 305 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  42.68 
 
 		 305 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  43.04 
 
 		 310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  43.1 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  42.68 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  42.68 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  41.84 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  41.01 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  39.92 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  39.08 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  39.32 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  37.45 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  32.22 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  34.04 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  35.19 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  32.49 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  35.35 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  32.68 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  36.11 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  32.61 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  32 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  33.51 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  33.51 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  31.38 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  32.98 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  32.26 
 
 		 281 aa  85.1  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  33.19 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  33.19 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  33.19 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  29.85 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  29.85 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  30.46 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  27.76 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  27.11 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  29.95 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  31.13 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  32.8 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  30.53 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  30.53 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  30.77 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  30.53 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  28.51 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  28.51 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  28.51 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  30 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  27.92 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  31.2 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2859  ATP-binding protein  25.33 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.409407  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  28.77 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  29.05 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  29.48 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  27.16 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  27.16 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  27.16 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  27.16 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  27.08 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  27.27 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  26.5 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  28.1 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  28.81 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  25.91 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0958  hypothetical protein  22.67 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117269  hitchhiker  0.00182599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0828  spermine synthase  26.07 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.547147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  20.74 
 
 		 308 aa  52  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  30.24 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  23.5 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  25.64 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  28.4 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  26.06 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  26.6 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  26.07 
 
 		 322 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  25.61 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  28.5 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>