185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3030 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  100 
 
 		 322 aa  651    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  34.62 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  32.84 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  27.14 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.92 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  29 
 
 		 558 aa  99.4  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  33.85 
 
 		 264 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  33.85 
 
 		 264 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  33.75 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.42 
 
 		 490 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  32.93 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  32 
 
 		 541 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  31.89 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  31.93 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  30.77 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  30.39 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  33.95 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  32.52 
 
 		 516 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  29.82 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  31.35 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  30.77 
 
 		 278 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  34.03 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  30.41 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  33.51 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  29.31 
 
 		 551 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  28.29 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  31.48 
 
 		 276 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  31.48 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  31.61 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  31.48 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  31.76 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  34.76 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  31.76 
 
 		 514 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  30.28 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  29.11 
 
 		 551 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  30.93 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  29.82 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.75 
 
 		 516 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  29.21 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  27.81 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  30.65 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  30.21 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  29.22 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  27 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  33.14 
 
 		 514 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  31.61 
 
 		 282 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  29.7 
 
 		 284 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  31.25 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  31.4 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  26.94 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  31.4 
 
 		 514 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  31.55 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  24.49 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  30.05 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  25.46 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  30.37 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  28.5 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  29.26 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  28.34 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04883  putative integral membrane protein  31.79 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  35.4 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  31.25 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1668  hypothetical protein  20.86 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  28.12 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  30.48 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  29.15 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  27.78 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  27.31 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  27.31 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  23.91 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  28.12 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1674  hypothetical protein  20.32 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  27.4 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  29.84 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  27.32 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  27.32 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  27.04 
 
 		 607 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  26.11 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  28.34 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  26.67 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  27.32 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  27.32 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  27.32 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  27.32 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  27.32 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  26.6 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  26.91 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  28 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  25.52 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  28.65 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  28.26 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  26.79 
 
 		 502 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2501  hypothetical protein  22.58 
 
 		 252 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  29.53 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  25.68 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  25.68 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  25.68 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  28.67 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  23.88 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>