76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0575 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  100 
 
 		 316 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  78.1 
 
 		 310 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  52 
 
 		 280 aa  262  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  38.83 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  42.01 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  38.85 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  40.99 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  43.07 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  42.51 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  38.49 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  42.24 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  41.26 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  37.74 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  39.46 
 
 		 289 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  35.59 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  35.77 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  35.91 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  37.26 
 
 		 273 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  40.15 
 
 		 287 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  35.71 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  35.24 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  36.05 
 
 		 332 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  34.93 
 
 		 517 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  34.18 
 
 		 500 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  31.64 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  32.3 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  36.4 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  36.44 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  32.89 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  33.6 
 
 		 516 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  35.06 
 
 		 517 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  32.68 
 
 		 514 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  32.68 
 
 		 514 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  31.29 
 
 		 492 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  31.53 
 
 		 261 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  32.56 
 
 		 514 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  31.33 
 
 		 514 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  30.74 
 
 		 514 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  33.49 
 
 		 262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  30.51 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  35.12 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  32.43 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  30.41 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  31.75 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  25.1 
 
 		 558 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  30.63 
 
 		 516 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  29.55 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  30.92 
 
 		 974 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  32.61 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  25.1 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  32.56 
 
 		 551 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  27.78 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  28 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  27.27 
 
 		 276 aa  54.3  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  29.89 
 
 		 548 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  25 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  28.18 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  30 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  28.31 
 
 		 490 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  27.59 
 
 		 551 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  30.23 
 
 		 334 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  25.27 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  31.86 
 
 		 231 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  28.57 
 
 		 824 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  28.1 
 
 		 533 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  28.34 
 
 		 284 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  32.87 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  28.95 
 
 		 544 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  35.09 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  20.91 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  35.09 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  35.09 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  32.87 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  28.3 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2981  spermidine synthase  29.72 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  25 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>