98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3722 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  91.63 
 
 
514 aa  931    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1003    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  89.49 
 
 
514 aa  907    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  97.67 
 
 
514 aa  979    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  91.44 
 
 
514 aa  929    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  51.7 
 
 
516 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  47.07 
 
 
517 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  47.2 
 
 
517 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  44.69 
 
 
492 aa  336  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  42.35 
 
 
500 aa  317  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  29.98 
 
 
490 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  38.58 
 
 
287 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  39.31 
 
 
285 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  39.69 
 
 
285 aa  159  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  41.64 
 
 
284 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  39.61 
 
 
296 aa  157  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  40.72 
 
 
287 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  38.34 
 
 
273 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  38.4 
 
 
287 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  29.03 
 
 
551 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.17 
 
 
558 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  29.87 
 
 
541 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  36.51 
 
 
281 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  34.36 
 
 
307 aa  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  34.15 
 
 
607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  34.5 
 
 
276 aa  131  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  31.91 
 
 
282 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  37.3 
 
 
262 aa  127  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  36.17 
 
 
289 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  25.57 
 
 
516 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  36.25 
 
 
273 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  29.49 
 
 
524 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  33.7 
 
 
261 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  33.59 
 
 
332 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  27.31 
 
 
517 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  29.15 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  32.56 
 
 
316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  32.91 
 
 
310 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  37.57 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  32.68 
 
 
271 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  27.36 
 
 
502 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  32.02 
 
 
304 aa  103  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  24.11 
 
 
533 aa  100  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  29.16 
 
 
548 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  33.65 
 
 
280 aa  99  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  26.03 
 
 
544 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  26.79 
 
 
551 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  25.27 
 
 
974 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  39.51 
 
 
266 aa  97.4  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  31.98 
 
 
272 aa  97.1  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  29.21 
 
 
551 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  32.03 
 
 
315 aa  94.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  33.89 
 
 
320 aa  91.3  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  29.74 
 
 
262 aa  89  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  29.28 
 
 
261 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  30.99 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  32.09 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  25.09 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  31.02 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  26.04 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  28.11 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  31.4 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.61 
 
 
248 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  28.33 
 
 
339 aa  69.7  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  26.05 
 
 
308 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  27.49 
 
 
475 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  27.56 
 
 
334 aa  59.3  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  29.7 
 
 
248 aa  58.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  24.54 
 
 
220 aa  57  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  31.58 
 
 
705 aa  56.6  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  31.58 
 
 
705 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  36.17 
 
 
678 aa  56.6  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  31.21 
 
 
876 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  27.91 
 
 
251 aa  55.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  33.57 
 
 
1078 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  33.57 
 
 
1078 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  29.63 
 
 
307 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  34.29 
 
 
1079 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  23.42 
 
 
835 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  28.65 
 
 
991 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  30.52 
 
 
255 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  26.64 
 
 
759 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  23.3 
 
 
819 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  28.29 
 
 
759 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  31.58 
 
 
674 aa  47  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  24.35 
 
 
1017 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  26.9 
 
 
205 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  30.18 
 
 
844 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  31.97 
 
 
681 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  32.11 
 
 
752 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  29.65 
 
 
982 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  21.88 
 
 
749 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  30 
 
 
735 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  35.42 
 
 
744 aa  44.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  24.28 
 
 
803 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  29.51 
 
 
789 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  32.23 
 
 
283 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.725574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>