106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1268 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 320 aa  614  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  52.58 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  46.82 
 
 		 304 aa  221  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  40.19 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  42.63 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  44.71 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  49.34 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  49.34 
 
 		 280 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  41.06 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  48.02 
 
 		 285 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  46.7 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  45.31 
 
 		 315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  40.21 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  42.06 
 
 		 273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  48.03 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  44.39 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  42.34 
 
 		 281 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  36.75 
 
 		 273 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  35.03 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  37.41 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  41.33 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  39.34 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  37.22 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  38.64 
 
 		 261 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  37.8 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  34.58 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  40.55 
 
 		 516 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  37.13 
 
 		 517 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  37.5 
 
 		 262 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  34.53 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  32.53 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  33.49 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  36.61 
 
 		 492 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  37.24 
 
 		 517 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  34.02 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  35.21 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  33.89 
 
 		 514 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  33.89 
 
 		 514 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  33.89 
 
 		 514 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  34.44 
 
 		 514 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 514 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  34.98 
 
 		 266 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  34.3 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  34.5 
 
 		 286 aa  85.9  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  31.82 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  26.92 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  23.93 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  29.79 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  25 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  30.82 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2629  hypothetical protein  33.57 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  25.36 
 
 		 516 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  22.29 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  26.03 
 
 		 247 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  25 
 
 		 247 aa  53.1  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  23.85 
 
 		 221 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.25 
 
 		 490 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  25.47 
 
 		 533 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  26.17 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  26.17 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  26.17 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  25.26 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  22.86 
 
 		 551 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  25.82 
 
 		 339 aa  49.7  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  26.17 
 
 		 247 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.57 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  23.29 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  23.29 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  23.29 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  23.29 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1034  hypothetical protein  30.21 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0225297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  23.29 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  32.97 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.15 
 
 		 502 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  30.36 
 
 		 752 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  23.28 
 
 		 247 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  27.07 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  26.02 
 
 		 974 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0745  spermine synthase  25 
 
 		 247 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0913  spermidine synthase-like  28.57 
 
 		 253 aa  46.6  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  28.26 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  33.76 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  28.26 
 
 		 276 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  30.34 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  28.67 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  27.32 
 
 		 254 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  28.26 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0482  hypothetical protein  30.13 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  31.85 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  29.52 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0791  spermine synthase  26.51 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  23.81 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  28 
 
 		 548 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  28.33 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  31.58 
 
 		 551 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  28.37 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  32.74 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  27.18 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  26.95 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  26.06 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>