123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0695 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 271 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  40.08 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  37.07 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  41.07 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  39.56 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  34.62 
 
 		 273 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  36.49 
 
 		 268 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  39.91 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  33.7 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  34.93 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  36.61 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  36.72 
 
 		 332 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  36.24 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  37.31 
 
 		 492 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  36.4 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  35.18 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  34.47 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  33.2 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  34.47 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  37.7 
 
 		 500 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  35.77 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  36.41 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  44.44 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  33.03 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  33.2 
 
 		 517 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  34.01 
 
 		 514 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  36.13 
 
 		 517 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  36.61 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 516 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  29.7 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  32.68 
 
 		 514 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  33.17 
 
 		 514 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  31.98 
 
 		 514 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  31.98 
 
 		 514 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  32.67 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  42.2 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  33.63 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  33.04 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  31.72 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  32.89 
 
 		 315 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  38.85 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  34.86 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  29.14 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  30.08 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  28.12 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  28.83 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  30.43 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  28.83 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  28.83 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  28.19 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  25.71 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  27.37 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  27.37 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  27.53 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  27.7 
 
 		 974 aa  55.8  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  27.53 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  27.08 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  27.4 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  25.69 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  28.83 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  26.97 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.31 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  32.17 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.25 
 
 		 516 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  25.87 
 
 		 551 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44275  predicted protein  25.57 
 
 		 824 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  26.72 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  27.86 
 
 		 490 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  28.18 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  28.09 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  28.26 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0901  hypothetical protein  26.72 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  27.54 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  27.75 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  27.73 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  25.52 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  27.75 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  26.62 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  28.42 
 
 		 510 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  25.33 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  23.81 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  28.29 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  26.63 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  26.63 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  28.08 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  31.15 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2384  spermidine synthase-like protein  28.8 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  26.63 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0482  hypothetical protein  30.71 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  24.7 
 
 		 541 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  28.18 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  26.88 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  31.97 
 
 		 305 aa  46.6  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  27.17 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  24.66 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  27.59 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  26.02 
 
 		 752 aa  45.8  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  23.44 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  29.57 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>