85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0901 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0901  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  523  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3042  putative spermidine synthase  35.34 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.784993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  32.21 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3636  spermine synthase  34.53 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3513  spermine synthase  34.53 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0851  spermine synthase  34.53 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3442  Spermine synthase  34.53 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  30.08 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  32.28 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0898  spermine synthase  33.81 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0615  putative spermidine synthase  32.35 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  32.59 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  33.07 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.34 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  27.1 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  27.67 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3220  spermine synthase  32.37 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0803  spermine synthase  32.37 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2160  spermine synthase  33.58 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.55651  normal  0.223021 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  27.67 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3323  spermine synthase  32.37 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  28.24 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  33.64 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0960  spermidine synthase  31.78 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  30.99 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  27.67 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0901  Spermine synthase  28.19 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0941  hypothetical protein  31.91 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.330674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  30.6 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0958  hypothetical protein  29.63 
 
 		 364 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0764125  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  27.38 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2906  putative spermidine synthase  26.9 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  31.53 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  30.91 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0836  hypothetical protein  30.71 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0292  hypothetical protein  29.63 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1162  hypothetical protein  29.63 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0856  hypothetical protein  29.63 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1009  hypothetical protein  29.63 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.943878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1944  hypothetical protein  29.63 
 
 		 387 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227944  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  27.01 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1321  hypothetical protein  29.63 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.959568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1170  hypothetical protein  29.63 
 
 		 398 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2160  hypothetical protein  30.85 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1819  putative transferase  30.85 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  29.37 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  30.63 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  30.63 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  29.37 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2285  putative spermidine synthase  25.74 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  26.57 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  29.58 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  26.76 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  30 
 
 		 271 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0938  spermidine synthase-like protein  30.37 
 
 		 305 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0771675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2362  spermidine synthase-like protein  30.37 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  27.27 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2339  spermidine synthase-like protein  30.37 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1727  spermidine synthase-like  30.37 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435957  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  30.58 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5682  spermidine synthase-like  29.01 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385407  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  28.36 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  26.72 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  29.93 
 
 		 307 aa  48.9  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2258  spermidine synthase-like protein  28.89 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  27.97 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  29.63 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2378  spermidine synthase-like protein  28.89 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0927  spermine synthase  33.59 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2336  hypothetical protein  25.36 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.32 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2497  hypothetical protein  28.78 
 
 		 310 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00914951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0791  spermine synthase  29.63 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618517 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0860  hypothetical protein  28.57 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.790744  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1223  hypothetical protein  31.18 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  31.18 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  29.46 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1738  Spermidine synthase-like protein  23.75 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  24.83 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  27.73 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0995  hypothetical protein  26.62 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4021  hypothetical protein  27.15 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.687307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  26.19 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0925  hypothetical protein  27.86 
 
 		 291 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.759797  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1668  hypothetical protein  22.81 
 
 		 241 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>