65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  526  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  59.43 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  54.72 
 
 		 272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  48.21 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  46.75 
 
 		 262 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  41.78 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  40.67 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  40.37 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  36.75 
 
 		 273 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  39.74 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  39.64 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  38.12 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  35.84 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  44.44 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  39.43 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  37.61 
 
 		 332 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  40.37 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  34.44 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  34.58 
 
 		 304 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  39.01 
 
 		 517 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  38.92 
 
 		 517 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  37.07 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  33.65 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  38.33 
 
 		 500 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  35.29 
 
 		 492 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  36.36 
 
 		 280 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  33.71 
 
 		 307 aa  98.6  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  32.74 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  32.43 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  37.17 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  39.39 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  37.07 
 
 		 516 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  44.53 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  34.84 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  32.09 
 
 		 514 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  32.62 
 
 		 514 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  29.69 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  30.99 
 
 		 514 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  32.9 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  30.99 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  31.86 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  32.02 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  27.78 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  28.25 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  33.05 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1248  hypothetical protein  26.11 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  23.32 
 
 		 322 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  24.85 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  27.46 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  31.35 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  29.41 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  29.27 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  31.75 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1067  hypothetical protein  26.92 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.153628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  26.52 
 
 		 974 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  31.71 
 
 		 291 aa  43.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  22.22 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  25.14 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  29.34 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  31.25 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  31.33 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  22.09 
 
 		 308 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  24.54 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  30.25 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>