100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2801 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1005    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  89.49 
 
 
514 aa  907    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  88.33 
 
 
514 aa  896    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  88.91 
 
 
514 aa  899    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  88.13 
 
 
514 aa  894    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  53.82 
 
 
516 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  48.37 
 
 
517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  48.21 
 
 
517 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  46.28 
 
 
492 aa  339  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  42.56 
 
 
500 aa  315  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.43 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  45.29 
 
 
284 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  42.27 
 
 
285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  40 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  38.58 
 
 
287 aa  154  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  27.9 
 
 
558 aa  154  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  41.75 
 
 
287 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  41.82 
 
 
285 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  39.13 
 
 
273 aa  150  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  30.74 
 
 
541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  43.43 
 
 
287 aa  141  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  29.42 
 
 
551 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  40.62 
 
 
281 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  36.43 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  35.31 
 
 
289 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  34.78 
 
 
282 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  34.36 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  33.81 
 
 
607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  28.41 
 
 
517 aa  124  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  39.91 
 
 
262 aa  123  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  29.4 
 
 
524 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  30.48 
 
 
510 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  32.77 
 
 
310 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  35.86 
 
 
273 aa  116  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  33.7 
 
 
261 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  25.1 
 
 
516 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  31.33 
 
 
316 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  29.96 
 
 
548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  28.09 
 
 
502 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  33.59 
 
 
332 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  33.17 
 
 
271 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  29.43 
 
 
551 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  36.99 
 
 
268 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  32.5 
 
 
304 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.66 
 
 
533 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  34.31 
 
 
280 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  25.75 
 
 
974 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  33.92 
 
 
315 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  38.89 
 
 
266 aa  96.3  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  26.57 
 
 
551 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  32.67 
 
 
272 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  34.44 
 
 
320 aa  90.5  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  30.11 
 
 
262 aa  89  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  32.72 
 
 
309 aa  87  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  24.64 
 
 
544 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  31.49 
 
 
261 aa  86.7  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  32.62 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  29.63 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  32.74 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  29.17 
 
 
339 aa  73.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  33.14 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  31.01 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  26.59 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  27.37 
 
 
203 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  24.77 
 
 
308 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  31.82 
 
 
248 aa  63.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  27.35 
 
 
705 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  34.09 
 
 
705 aa  62.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  40.23 
 
 
678 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  28.51 
 
 
251 aa  56.6  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  25.51 
 
 
334 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  25.31 
 
 
220 aa  55.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  29.68 
 
 
876 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  23.84 
 
 
835 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  27.9 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  35.38 
 
 
1078 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  35.38 
 
 
1078 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  29.17 
 
 
307 aa  50.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  33.94 
 
 
752 aa  50.4  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  23.86 
 
 
819 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  25.91 
 
 
1017 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3050  spermine synthase  24.72 
 
 
842 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  36.15 
 
 
1079 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  30.68 
 
 
255 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  29.07 
 
 
844 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  31 
 
 
735 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  32.73 
 
 
681 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  29.38 
 
 
991 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  31.58 
 
 
674 aa  47  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  30.81 
 
 
982 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  31.19 
 
 
759 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  21.97 
 
 
803 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  33.98 
 
 
759 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  31.43 
 
 
983 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  28.86 
 
 
231 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  35.11 
 
 
744 aa  45.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  25.5 
 
 
257 aa  43.9  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  26.4 
 
 
276 aa  43.9  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  27.32 
 
 
836 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>