126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3599 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  68.32 
 
 		 276 aa  329  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  58.02 
 
 		 287 aa  281  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  55.73 
 
 		 285 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  56.11 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  50.57 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2329  hypothetical protein  48.28 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1355  Spermidine synthase-like protein  50.19 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  49.61 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  48.81 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  45.49 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4795  hypothetical protein  42.74 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2514  putative spermidine synthase  42.23 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246608  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  40.96 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  42.42 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  39.49 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  45.82 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  44.02 
 
 		 261 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  42.61 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  39.46 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  38.33 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  41.11 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  42.02 
 
 		 516 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  40.72 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  38.14 
 
 		 517 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  38.37 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  35.74 
 
 		 514 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  35.74 
 
 		 514 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  36.61 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  37.55 
 
 		 517 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  35.31 
 
 		 514 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  38.5 
 
 		 500 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02530  hypothetical protein  40.37 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  38.06 
 
 		 492 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  41.89 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  34.6 
 
 		 514 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  39.3 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  36.17 
 
 		 514 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  39.06 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22530  hypothetical protein  41.35 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06000  hypothetical protein  42.29 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  39.72 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1061  hypothetical protein  28.83 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  25.49 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  28.5 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.67 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  29.03 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  32.03 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05370  hypothetical protein  28.39 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  32.19 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  30.56 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  24.48 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  24.55 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0330  putative spermidine synthase  29.37 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3989  hypothetical protein  30.14 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  21.74 
 
 		 558 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0180  putative acyl transferase  27.27 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1442  hypothetical protein  29.45 
 
 		 251 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280635 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  23.01 
 
 		 533 aa  52.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  28.47 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  28.47 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  34.72 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1867  hypothetical protein  29.45 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1476  hypothetical protein  30.06 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  29.82 
 
 		 678 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  31.71 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3848  hypothetical protein  29.45 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0392798  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  29.69 
 
 		 290 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  28.08 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  29.11 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  27.78 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  28.08 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27350  hypothetical protein  26.67 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  27.78 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2313  hypothetical protein  27.81 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.28 
 
 		 502 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  27.78 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1773  hypothetical protein  29.05 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.738032  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  27.4 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  26.86 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  24.35 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5396  hypothetical protein  26 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2311  spermidine synthase-like protein  29.3 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15340  hypothetical protein  30.06 
 
 		 249 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3883  hypothetical protein  27.16 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.469357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0564  spermidine synthase  28.33 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3621  hypothetical protein  28.38 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  29.45 
 
 		 282 aa  45.8  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  22.37 
 
 		 283 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  28.68 
 
 		 752 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  21.57 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  26.17 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  25.29 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  25.29 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  27.04 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  22.1 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  24.4 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0521  putative spermidine synthase  25.17 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0537  spermidine synthase  30.66 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>