148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0507 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  100 
 
 		 251 aa  521  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04160  spermidine synthase  34.12 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  34.75 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06540  spermidine synthase  33.99 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1190  Spermidine synthase-like protein  29.58 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0142358  normal  0.0659665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  30.14 
 
 		 490 aa  85.5  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  29.82 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  26.64 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  28.66 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  30.07 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  28.49 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  28.34 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  28.12 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0102  spermidine synthase  30.73 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1549  hypothetical protein  30.22 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  31.25 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3103  Spermidine synthase-like protein  30.34 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0362  putative spermidine synthase  28.07 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  28.78 
 
 		 607 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  26.2 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1581  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.564591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  30.37 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  28.99 
 
 		 500 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  29.33 
 
 		 492 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1738  Spermidine synthase-like protein  25.49 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  28.48 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  29.66 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  29.07 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4617  hypothetical protein  27.27 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  29.07 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10680  hypothetical protein  29.27 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00411516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  28.81 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  29.07 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0575  putative spermidine synthase  27.78 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1268  Spermidine synthase-like protein  28.85 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0248  spermine synthase  28.57 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.190806  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  30.14 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15982  predicted protein  31.71 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283158  normal  0.0285818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4663  putative spermidine synthase  30.06 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  28.51 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5699  putative spermidine synthase protein  30.07 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  29.03 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  26.74 
 
 		 551 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  27.91 
 
 		 514 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  29.66 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  30.07 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  26.4 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  26.6 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  27.13 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  30.94 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  26.6 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  28.07 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  27.14 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3030  spermine synthase  29.08 
 
 		 322 aa  53.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  26.53 
 
 		 516 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  27.14 
 
 		 974 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  28.32 
 
 		 287 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01820  hypothetical protein  26.84 
 
 		 309 aa  52.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  27.94 
 
 		 288 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  27.94 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  27.94 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  26.19 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  27.94 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  29.14 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  27.94 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  27.94 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  27.94 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  27.94 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  28.93 
 
 		 548 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  28.45 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40259  predicted protein  26.03 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0644688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  25.71 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  27.59 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0771  hypothetical protein  28.12 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  25.5 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  27.43 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  29.8 
 
 		 551 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  25.62 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0695  Spermidine synthase-like protein  25.52 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  26.55 
 
 		 289 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  29.1 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  27.07 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  24.83 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6267  spermidine synthase-like protein  27.74 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.526143 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6553  spermidine synthase-like protein  27.74 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1946  spermidine synthase-like protein  26.87 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  22.79 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2143  spermidine synthase-like protein  25.42 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.122833  normal  0.469239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  24.38 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  25.66 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  25.66 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  25.66 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  25.66 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  29.57 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  30.71 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4588  spermidine synthase-like protein  32.43 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.213578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  24.05 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3599  hypothetical protein  24.35 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>