33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_15982 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009361  OSTLU_15982  predicted protein  100 
 
 		 332 aa  654    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283158  normal  0.0285818 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0507  spermine synthase  31.97 
 
 		 251 aa  57  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0453861  normal  0.458403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  28.57 
 
 		 248 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  30.19 
 
 		 502 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  29.7 
 
 		 536 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  28.32 
 
 		 255 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  32.03 
 
 		 678 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  33.04 
 
 		 522 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  24.16 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  35.54 
 
 		 523 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  29.73 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  26.46 
 
 		 528 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  33.58 
 
 		 510 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27620  spermidine synthase  33.33 
 
 		 257 aa  46.2  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.090706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  27.34 
 
 		 516 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  32.52 
 
 		 538 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  28.49 
 
 		 520 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  24.42 
 
 		 533 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2801  spermine synthase  25.44 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  27.96 
 
 		 520 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  27.96 
 
 		 520 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  30.58 
 
 		 521 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  26.55 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  30.91 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  32.48 
 
 		 681 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  34.23 
 
 		 752 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47247  predicted protein  29.55 
 
 		 467 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000828474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  27.59 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  24.75 
 
 		 548 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  36 
 
 		 520 aa  43.1  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5272  spermidine synthase-like protein  28.21 
 
 		 281 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  28.93 
 
 		 475 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  25.5 
 
 		 551 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>