57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0745 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  100 
 
 
705 aa  1418    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  98.72 
 
 
705 aa  1404    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  31.43 
 
 
759 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  32.7 
 
 
759 aa  365  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  32.79 
 
 
760 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  31.64 
 
 
759 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  32.97 
 
 
759 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  34.05 
 
 
735 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  32.64 
 
 
789 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  30.43 
 
 
744 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  31.82 
 
 
752 aa  299  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  31.19 
 
 
752 aa  290  8e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  30.62 
 
 
678 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  28.12 
 
 
681 aa  240  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  29.43 
 
 
674 aa  239  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0691  hypothetical protein  30.88 
 
 
791 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140408  normal  0.176314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  37.19 
 
 
558 aa  67.8  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  27.35 
 
 
514 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  26.02 
 
 
533 aa  62  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  28.09 
 
 
500 aa  61.6  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  22.19 
 
 
516 aa  60.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  29.32 
 
 
516 aa  60.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  26.92 
 
 
514 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  31.58 
 
 
514 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  31.82 
 
 
514 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2075  Spermidine synthase-like protein  30.06 
 
 
287 aa  58.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000156685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  31.62 
 
 
548 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  31.58 
 
 
514 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1526  hypothetical protein  31.93 
 
 
296 aa  56.2  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  31.62 
 
 
551 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  33.06 
 
 
311 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2683  Spermidine synthase-like protein  29.63 
 
 
281 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  23.43 
 
 
502 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  32.52 
 
 
490 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  32.99 
 
 
541 aa  52  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  28.1 
 
 
257 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  26.56 
 
 
287 aa  52  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7684  hypothetical protein  28.46 
 
 
273 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  29.66 
 
 
492 aa  49.7  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  26.11 
 
 
517 aa  48.1  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  30.91 
 
 
307 aa  48.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2425  hypothetical protein  25.83 
 
 
307 aa  47.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503783  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  26.32 
 
 
248 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2968  Spermidine synthase-like protein  29.1 
 
 
284 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0185015  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  29.08 
 
 
551 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  31.58 
 
 
334 aa  47.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1494  hypothetical protein  25.87 
 
 
285 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0134759  hitchhiker  0.000194556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  28.91 
 
 
517 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  31.76 
 
 
551 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  24.24 
 
 
471 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1674  hypothetical protein  28.69 
 
 
241 aa  45.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  28.57 
 
 
267 aa  44.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  27.87 
 
 
276 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  27.87 
 
 
269 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0336  putative spermidine synthase  27.5 
 
 
274 aa  44.3  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22930  spermidine synthase  29.41 
 
 
304 aa  44.3  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0650317 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  27.87 
 
 
284 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>