38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0123 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 752 aa  1514    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  36.08 
 
 		 752 aa  342  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  32.22 
 
 		 759 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  33.12 
 
 		 759 aa  328  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  33.72 
 
 		 760 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  33.68 
 
 		 789 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  32.09 
 
 		 759 aa  300  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  32.63 
 
 		 759 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  47.99 
 
 		 678 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  30.8 
 
 		 705 aa  287  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  30.62 
 
 		 705 aa  285  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  47.58 
 
 		 681 aa  264  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  45.79 
 
 		 674 aa  258  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  41.87 
 
 		 735 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  41.48 
 
 		 744 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0691  hypothetical protein  27.04 
 
 		 791 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140408  normal  0.176314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  35.29 
 
 		 248 aa  60.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  27.18 
 
 		 311 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  31.4 
 
 		 502 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  32.11 
 
 		 558 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  30.37 
 
 		 544 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  24.81 
 
 		 533 aa  51.2  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  30.23 
 
 		 516 aa  50.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  26.54 
 
 		 220 aa  50.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  25.23 
 
 		 307 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  36.36 
 
 		 492 aa  48.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  32.77 
 
 		 272 aa  48.5  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  28.57 
 
 		 558 aa  46.6  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  26.19 
 
 		 267 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  33.62 
 
 		 276 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  33.62 
 
 		 269 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  33.62 
 
 		 284 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  27.89 
 
 		 255 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  30.77 
 
 		 517 aa  45.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15982  predicted protein  34.23 
 
 		 332 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283158  normal  0.0285818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0334  putative spermidine synthase  30.25 
 
 		 257 aa  44.3  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  32.76 
 
 		 231 aa  44.3  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  26.95 
 
 		 261 aa  43.9  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>