31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2698 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  100 
 
 		 744 aa  1448    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  41.88 
 
 		 735 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  39.71 
 
 		 760 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  39.07 
 
 		 759 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  39.92 
 
 		 759 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  39.34 
 
 		 759 aa  441  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  40.91 
 
 		 759 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  41.33 
 
 		 789 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  32.43 
 
 		 705 aa  339  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  32.24 
 
 		 705 aa  338  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  35.13 
 
 		 752 aa  333  7.000000000000001e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  33.93 
 
 		 678 aa  327  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  35.19 
 
 		 674 aa  298  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  38.98 
 
 		 681 aa  178  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  36.5 
 
 		 752 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0691  hypothetical protein  38.38 
 
 		 791 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140408  normal  0.176314 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  24.15 
 
 		 533 aa  51.6  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  43.24 
 
 		 492 aa  51.2  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  32.56 
 
 		 551 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  28.35 
 
 		 307 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  32.56 
 
 		 558 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  34.65 
 
 		 516 aa  48.9  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  28.3 
 
 		 248 aa  48.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  30.43 
 
 		 544 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  38.33 
 
 		 272 aa  45.8  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  26.32 
 
 		 548 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  35.42 
 
 		 514 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  34.23 
 
 		 514 aa  45.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  35.42 
 
 		 514 aa  45.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  34.23 
 
 		 514 aa  44.3  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  34.23 
 
 		 514 aa  44.3  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>