55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2988 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  100 
 
 		 735 aa  1442    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  38.84 
 
 		 759 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  38.73 
 
 		 759 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  38.73 
 
 		 760 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  42.78 
 
 		 744 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  39.57 
 
 		 759 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  37.8 
 
 		 759 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  39.7 
 
 		 789 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  35.79 
 
 		 752 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  34.78 
 
 		 705 aa  358  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  34.38 
 
 		 705 aa  354  4e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  34.68 
 
 		 678 aa  350  4e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  36.79 
 
 		 674 aa  332  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  43.35 
 
 		 681 aa  214  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  38.85 
 
 		 752 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0691  hypothetical protein  35.71 
 
 		 791 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140408  normal  0.176314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  36.84 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  25.21 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4320  spermine/spermidine synthase family protein  33.33 
 
 		 311 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  28.88 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  35.79 
 
 		 541 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  33.88 
 
 		 492 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 475 aa  55.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  35.71 
 
 		 500 aa  55.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0169  spermidine synthase-like protein  35.94 
 
 		 284 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  33.94 
 
 		 307 aa  53.9  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  32.94 
 
 		 551 aa  53.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  33.87 
 
 		 268 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04663  spermine/spermidine synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G08500)  33.54 
 
 		 558 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725678  normal  0.343569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1704  spermidine synthase-like protein  35.04 
 
 		 287 aa  51.2  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406029  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  34.12 
 
 		 558 aa  50.8  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12080  spermidine synthase  32.17 
 
 		 272 aa  50.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.712162  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1537  spermine/spermidine synthase family protein  31.01 
 
 		 269 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0114  transferase  31.01 
 
 		 276 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  25.54 
 
 		 502 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1622  spermine/spermidine synthase family protein  31.01 
 
 		 284 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3670  spermidine synthase-like protein  24.38 
 
 		 261 aa  49.3  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  31 
 
 		 514 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0231  spermidine synthase  30.11 
 
 		 334 aa  48.1  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  28 
 
 		 551 aa  47.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6163  spermidine synthase-like protein  29.32 
 
 		 239 aa  47.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.523417  normal  0.0514114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  29.75 
 
 		 516 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  34.68 
 
 		 548 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1257  transferase  31.01 
 
 		 231 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1274  spermidine synthase-like protein  29.32 
 
 		 278 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2633  spermidine synthase-like  26.55 
 
 		 255 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0667731  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6557  spermidine synthase-like protein  29.32 
 
 		 278 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  30 
 
 		 514 aa  45.8  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  32 
 
 		 514 aa  45.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1722  spermidine synthase-like protein  30.17 
 
 		 289 aa  45.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  32 
 
 		 514 aa  45.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7063  spermidine synthase-like protein  28.89 
 
 		 282 aa  45.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0150  hypothetical protein  24.1 
 
 		 264 aa  45.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0321  putative transferase  24.1 
 
 		 264 aa  45.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.105369 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  23.22 
 
 		 516 aa  44.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>