23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2560 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  100 
 
 		 789 aa  1548    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  47.08 
 
 		 760 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  43 
 
 		 759 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  45.43 
 
 		 759 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  45.54 
 
 		 759 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  46.15 
 
 		 759 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0691  hypothetical protein  52.11 
 
 		 791 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140408  normal  0.176314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  38.39 
 
 		 752 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  41.22 
 
 		 744 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  32.41 
 
 		 705 aa  326  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  32.36 
 
 		 705 aa  325  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  33.68 
 
 		 752 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  34.16 
 
 		 674 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  43.45 
 
 		 735 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  42.19 
 
 		 678 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  40.5 
 
 		 681 aa  190  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  32.93 
 
 		 558 aa  51.2  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  34.86 
 
 		 517 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  30.28 
 
 		 248 aa  50.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 475 aa  46.2  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  30 
 
 		 541 aa  45.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  38.96 
 
 		 492 aa  44.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  28.8 
 
 		 267 aa  44.3  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.265162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>