18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0691 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2560  hypothetical protein  53.1 
 
 
789 aa  686    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0691  hypothetical protein  100 
 
 
791 aa  1439    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140408  normal  0.176314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2015  hypothetical protein  37.39 
 
 
760 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.491902  normal  0.484321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3374  hypothetical protein  35.06 
 
 
759 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.252874  hitchhiker  0.00751166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6156  hypothetical protein  34.38 
 
 
759 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263542  normal  0.152054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3287  hypothetical protein  34 
 
 
759 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.253593  normal  0.538496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4028  hypothetical protein  37.61 
 
 
759 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2698  putative transporter  35.33 
 
 
744 aa  264  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2736  hypothetical protein  30.85 
 
 
752 aa  242  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  30.38 
 
 
735 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0726  hypothetical protein  25.55 
 
 
705 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0745  hypothetical protein  25.68 
 
 
705 aa  190  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0123  integral membrane protein-like protein  28.91 
 
 
752 aa  181  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1508  integral membrane protein-like  28.87 
 
 
674 aa  148  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0141137  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1694  integral membrane protein-like  33.69 
 
 
678 aa  132  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0225851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0459  integral membrane protein-like protein  33.69 
 
 
681 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0899  Spermine synthase  33.64 
 
 
248 aa  51.2  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7524  putative spermidine synthase (methyl transferase)  33.04 
 
 
307 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>