47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0900 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  384  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1332  spermine synthase  41.94 
 
 		 490 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.020389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1561  Spermine synthase  41.03 
 
 		 502 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  35.5 
 
 		 516 aa  121  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1226  hypothetical protein  41.36 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1238  spermine synthase  43.9 
 
 		 524 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.103635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4321  hypothetical protein  37.5 
 
 		 220 aa  113  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2138  hypothetical protein  38.38 
 
 		 533 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641622  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1135  spermine synthase  37.17 
 
 		 558 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0187668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  38.6 
 
 		 607 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  36.41 
 
 		 541 aa  98.2  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0932  spermidine synthase-like protein  36 
 
 		 551 aa  98.2  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7525  hypothetical protein  35.52 
 
 		 205 aa  97.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  37.57 
 
 		 544 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3243  hypothetical protein  33.51 
 
 		 974 aa  95.9  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.870194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3004  Spermine synthase  34.39 
 
 		 551 aa  95.5  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2030  Spermine synthase  38.12 
 
 		 510 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3177  spermidine synthase-like protein  38.1 
 
 		 548 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2904  spermidine synthase-like protein  36.02 
 
 		 551 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0442  hypothetical protein  35.67 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0371  hypothetical protein  35 
 
 		 517 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3722  hypothetical protein  28.11 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5354  hypothetical protein  28.42 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5605  hypothetical protein  28.42 
 
 		 514 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5405  hypothetical protein  28.42 
 
 		 514 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62211  normal  0.453689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4192  hypothetical protein  34.04 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.216811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2801  hypothetical protein  27.37 
 
 		 514 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3029  hypothetical protein  35.71 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  30.85 
 
 		 749 aa  65.1  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  29.06 
 
 		 1078 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1079 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  30.69 
 
 		 1078 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2255  hypothetical protein  31.9 
 
 		 492 aa  62.4  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3006  hypothetical protein  29.73 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2892  spermine synthase  31.54 
 
 		 876 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0533  Methyltransferase type 12  32.22 
 
 		 475 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3618  spermine synthase  29.9 
 
 		 835 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3570  spermine synthase  27.16 
 
 		 803 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.960569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  29.53 
 
 		 782 aa  48.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0517  spermine synthase  27.22 
 
 		 836 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4101  spermidine synthase-like  28.65 
 
 		 471 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4527  Spermine synthase  26.29 
 
 		 844 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0178868 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3062  spermine synthase  28.9 
 
 		 983 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  29.21 
 
 		 982 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2131  spermine/spermidine synthase family transmembrane protein  25.82 
 
 		 830 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355306  normal  0.0157921 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1825  spermine synthase  26.86 
 
 		 991 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1363  spermine synthase  28.25 
 
 		 819 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.871378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>