101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10381 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  48.26 
 
 		 313 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  44.15 
 
 		 298 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  44.15 
 
 		 298 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  42.27 
 
 		 330 aa  160  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  44.02 
 
 		 297 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  42.31 
 
 		 305 aa  160  9e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  41.85 
 
 		 303 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  41.94 
 
 		 294 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  41.94 
 
 		 301 aa  147  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  40.98 
 
 		 298 aa  132  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  38.38 
 
 		 289 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  38.38 
 
 		 289 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  38.6 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  37.72 
 
 		 300 aa  111  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  39.39 
 
 		 303 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  36.26 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  27.93 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  26.74 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  24.87 
 
 		 340 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  36.99 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  37.5 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  34.04 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  41.38 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  32.63 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  35.53 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  30 
 
 		 500 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  39.29 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  32.63 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  33.8 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  24.08 
 
 		 340 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  35.63 
 
 		 644 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4486  hypothetical protein  35.71 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  26.32 
 
 		 366 aa  52.4  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.94 
 
 		 667 aa  52.4  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  32.61 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  30.99 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  23.57 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3155  protein of unknown function DUF752  37.5 
 
 		 238 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  29.23 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  39.62 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  35.71 
 
 		 328 aa  49.3  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  28.57 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  32.2 
 
 		 227 aa  48.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  30.51 
 
 		 257 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  35.85 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  29.33 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3359  hypothetical protein  35.14 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3384  hypothetical protein  25.24 
 
 		 705 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  34.78 
 
 		 653 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  30.67 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002869  5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme MnmC  22.92 
 
 		 672 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103068  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  33.33 
 
 		 690 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.91 
 
 		 655 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2245  hypothetical protein  30.49 
 
 		 262 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000444033 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0743  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  29.67 
 
 		 668 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2891  protein of unknown function DUF752  33.93 
 
 		 240 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.0591468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  28.81 
 
 		 227 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 672 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4644  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  33.8 
 
 		 645 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683342  hitchhiker  0.0000257745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  33.96 
 
 		 668 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  29.63 
 
 		 668 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 665 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.63 
 
 		 668 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.88 
 
 		 672 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2586  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.76 
 
 		 675 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  33.96 
 
 		 668 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1751  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.43 
 
 		 654 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266449  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  34.78 
 
 		 660 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 659 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  24.69 
 
 		 617 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3963  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.43 
 
 		 654 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.94523  normal  0.0279642 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03106  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.08 
 
 		 672 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.43 
 
 		 654 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.4 
 
 		 668 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 644 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.33 
 
 		 657 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3653  hypothetical protein  30.99 
 
 		 249 aa  42.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1694  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.24 
 
 		 674 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00252388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.08 
 
 		 668 aa  42.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.19 
 
 		 675 aa  43.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1458  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.39 
 
 		 675 aa  42.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  33.93 
 
 		 261 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.4 
 
 		 668 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.4 
 
 		 668 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.4 
 
 		 668 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1429  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 268 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1410  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 		 689 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000203784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0372  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 		 689 aa  42  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000353518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 		 689 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252518  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.85 
 
 		 612 aa  42  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  28.57 
 
 		 699 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.78 
 
 		 654 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  36.36 
 
 		 676 aa  41.6  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2988  hypothetical protein  33.85 
 
 		 735 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  30.51 
 
 		 226 aa  41.6  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1208  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.31 
 
 		 612 aa  41.2  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19400  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.67 
 
 		 654 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.78 
 
 		 657 aa  41.2  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>