149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0640 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  44.64 
 
 
230 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  43.38 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  36.77 
 
 
257 aa  178  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  41.1 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  39.47 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  36.61 
 
 
227 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  38.25 
 
 
226 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  38.39 
 
 
226 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  38.68 
 
 
221 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  33.79 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  35.43 
 
 
226 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  27.57 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  26.79 
 
 
225 aa  88.6  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1887  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.07 
 
 
672 aa  83.2  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1378  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.11 
 
 
668 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2891  protein of unknown function DUF752  26.94 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.0591468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4644  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  29.25 
 
 
645 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683342  hitchhiker  0.0000257745 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4486  hypothetical protein  26.64 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3155  protein of unknown function DUF752  26.24 
 
 
238 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  28.23 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  28.22 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  27.85 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  27.1 
 
 
225 aa  75.1  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3359  hypothetical protein  26.03 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.45 
 
 
672 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  30.81 
 
 
635 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.07 
 
 
656 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  28.25 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.56 
 
 
672 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  26.46 
 
 
617 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  28.51 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2424  hypothetical protein  26.29 
 
 
637 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  26.09 
 
 
653 aa  72  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3401  hypothetical protein  28.51 
 
 
674 aa  72  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.473665  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  28.76 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  26.87 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.04 
 
 
657 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2983  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  26.92 
 
 
620 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  28.92 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.53 
 
 
657 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  27.01 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.11 
 
 
657 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3932  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.96 
 
 
656 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  23.94 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1796  hypothetical protein  25.46 
 
 
639 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1926  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25.46 
 
 
639 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2914  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.16 
 
 
660 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0217  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.16 
 
 
660 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.5 
 
 
708 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.5 
 
 
708 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.68 
 
 
644 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.15 
 
 
655 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  26.34 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  26.05 
 
 
622 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  28.19 
 
 
690 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  25.84 
 
 
313 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1628  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.16 
 
 
711 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.16 
 
 
711 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2973  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.16 
 
 
711 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  27.94 
 
 
298 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2343  hypothetical protein  27.03 
 
 
637 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.955559  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  23.33 
 
 
296 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2377  hypothetical protein  24.55 
 
 
667 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  25.96 
 
 
300 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  27.14 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  27.05 
 
 
266 aa  62.4  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3230  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.64 
 
 
657 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  26.79 
 
 
266 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  26.92 
 
 
298 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.45 
 
 
668 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1861  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25.7 
 
 
661 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.45 
 
 
668 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.5 
 
 
659 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  26.73 
 
 
303 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2586  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.01 
 
 
675 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1489  hypothetical protein  25.45 
 
 
666 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.94 
 
 
653 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1070  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.73 
 
 
680 aa  58.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.388206  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  27.75 
 
 
330 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25 
 
 
668 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1358  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.91 
 
 
672 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0608182  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.78 
 
 
676 aa  57.8  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2517  hypothetical protein  23.98 
 
 
585 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.89 
 
 
668 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 
668 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1494  hypothetical protein  25.33 
 
 
666 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  26.27 
 
 
631 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2872  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.34 
 
 
666 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  0.0703666 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  24.42 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1458  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.78 
 
 
675 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 
668 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 
673 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25 
 
 
668 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2568  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.55 
 
 
666 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.580805  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.55 
 
 
666 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3384  hypothetical protein  24.17 
 
 
705 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0743  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  26.09 
 
 
668 aa  55.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  24.55 
 
 
668 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2608  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.78 
 
 
666 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>