128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_06681 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  89.46 
 
 		 303 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  84.01 
 
 		 301 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  67.47 
 
 		 297 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  43.55 
 
 		 313 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  41.26 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  39.14 
 
 		 330 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  42.31 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  40.91 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  37.29 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  40.48 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  40.48 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  37.71 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  37.41 
 
 		 300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  37.24 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  36.9 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  41.94 
 
 		 187 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  32.14 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  31.53 
 
 		 254 aa  95.9  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  28.87 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  29.58 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  28.42 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  28.24 
 
 		 225 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  29.24 
 
 		 366 aa  89.4  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  28.7 
 
 		 500 aa  88.2  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  28.92 
 
 		 220 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  27.09 
 
 		 223 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  29.07 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  27.18 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  27.36 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  24.24 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  24.64 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  24.42 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  28.76 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  28.24 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  24.3 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  26.09 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  25.12 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  25.24 
 
 		 223 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  25.1 
 
 		 564 aa  67  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  27.36 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  28.97 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  28.32 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  24.89 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  25.49 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  24.89 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.7 
 
 		 679 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.22 
 
 		 678 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.75 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  24.66 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  26.29 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.85 
 
 		 659 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.73 
 
 		 660 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3932  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.15 
 
 		 656 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.21 
 
 		 665 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1796  hypothetical protein  25.68 
 
 		 639 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.97 
 
 		 657 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1926  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25.68 
 
 		 639 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.15 
 
 		 644 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.38 
 
 		 657 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.92 
 
 		 612 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4644  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  23.29 
 
 		 645 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683342  hitchhiker  0.0000257745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1751  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.61 
 
 		 654 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.42 
 
 		 657 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3963  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.61 
 
 		 654 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.94523  normal  0.0279642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.64 
 
 		 677 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.89 
 
 		 656 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.96 
 
 		 654 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1208  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.94 
 
 		 612 aa  50.8  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2891  protein of unknown function DUF752  32.81 
 
 		 240 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.0591468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  23.19 
 
 		 653 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.09 
 
 		 672 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.27 
 
 		 655 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4486  hypothetical protein  22.97 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1359  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.02 
 
 		 657 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490609  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2054  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25 
 
 		 655 aa  48.9  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3359  hypothetical protein  33.82 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3230  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.84 
 
 		 657 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3401  hypothetical protein  23.08 
 
 		 674 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.473665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.77 
 
 		 654 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1378  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.12 
 
 		 668 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  22.89 
 
 		 622 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  24.82 
 
 		 699 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.25 
 
 		 673 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0866  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  24.31 
 
 		 601 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.205507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  34.21 
 
 		 668 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  30.65 
 
 		 617 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.96 
 
 		 708 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.96 
 
 		 708 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.54 
 
 		 667 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  35.38 
 
 		 676 aa  46.6  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2424  hypothetical protein  24.68 
 
 		 637 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  24.76 
 
 		 225 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2568  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.89 
 
 		 666 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.580805  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  32.89 
 
 		 668 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  32.89 
 
 		 668 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.41 
 
 		 644 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.89 
 
 		 668 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  32.89 
 
 		 668 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  23.39 
 
 		 635 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>