51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0476 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  30.45 
 
 
500 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  27.71 
 
 
300 aa  85.9  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  28.63 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  28.46 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  30.38 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  29.07 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  29.93 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  23.26 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  26.72 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  26.94 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  29.92 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  31.55 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  27.24 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  32.55 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  27.04 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  23.83 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  24.3 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  25.23 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  28.57 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  26.64 
 
 
254 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  24.86 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  25.69 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  34.04 
 
 
187 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  22.6 
 
 
223 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  24.2 
 
 
617 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  22.12 
 
 
226 aa  52.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  25 
 
 
230 aa  52.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 
564 aa  52.4  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  22.37 
 
 
678 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  22.37 
 
 
679 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  31.82 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  21.46 
 
 
221 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.15 
 
 
657 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.42 
 
 
676 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  27.96 
 
 
257 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.08 
 
 
667 aa  47  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  25.89 
 
 
227 aa  45.8  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.94 
 
 
655 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  28.95 
 
 
653 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.09 
 
 
675 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  28.92 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  28.92 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  26.61 
 
 
227 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.37 
 
 
656 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.14 
 
 
677 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  25 
 
 
218 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  27.17 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  22.22 
 
 
225 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  20.79 
 
 
251 aa  42.7  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>