More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0261 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 564 aa  1161    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  35.02 
 
 		 313 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  34.24 
 
 		 328 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  36.61 
 
 		 311 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  35.76 
 
 		 314 aa  189  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1401  hypothetical protein  35.14 
 
 		 311 aa  186  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  35.06 
 
 		 321 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  32.75 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  32.75 
 
 		 311 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  35.12 
 
 		 307 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  35.48 
 
 		 311 aa  179  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  34.23 
 
 		 311 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  33.92 
 
 		 320 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  35.23 
 
 		 338 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 		 306 aa  174  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  30.34 
 
 		 317 aa  173  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  32.07 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  33.22 
 
 		 304 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  32.76 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  32.07 
 
 		 319 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  32.75 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  32.07 
 
 		 319 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0408  putative radical SAM protein  33.33 
 
 		 313 aa  171  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  32.07 
 
 		 319 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  31.72 
 
 		 319 aa  170  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  32.07 
 
 		 319 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  32.03 
 
 		 334 aa  170  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  30.64 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  32.07 
 
 		 319 aa  170  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  31.99 
 
 		 325 aa  170  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  31.72 
 
 		 319 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  32.07 
 
 		 319 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  34.33 
 
 		 309 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  31.53 
 
 		 305 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  34.33 
 
 		 309 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  33.56 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  35.27 
 
 		 312 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  29.63 
 
 		 318 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  33.96 
 
 		 309 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  32.47 
 
 		 319 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  33.96 
 
 		 309 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  34.69 
 
 		 308 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1850  hypothetical protein  29.66 
 
 		 317 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1815  hypothetical protein  29.66 
 
 		 317 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.501711  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  36.57 
 
 		 312 aa  166  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  33.67 
 
 		 318 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  34.33 
 
 		 309 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  34.7 
 
 		 309 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0890  hypothetical protein  32.11 
 
 		 315 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.896383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  35.36 
 
 		 314 aa  165  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  31.72 
 
 		 300 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  34.02 
 
 		 304 aa  163  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  33.96 
 
 		 309 aa  164  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  34.33 
 
 		 309 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  29.29 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  33.11 
 
 		 305 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  32.42 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  33.22 
 
 		 312 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  33.46 
 
 		 314 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  32.36 
 
 		 307 aa  161  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  31.06 
 
 		 313 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  35.4 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  34.3 
 
 		 322 aa  160  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  34.22 
 
 		 307 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  34.22 
 
 		 329 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  32.18 
 
 		 316 aa  160  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  29.69 
 
 		 319 aa  160  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  33.96 
 
 		 309 aa  159  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  33.84 
 
 		 328 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  34.98 
 
 		 309 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  34.22 
 
 		 327 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  30.31 
 
 		 317 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  34.6 
 
 		 309 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  33.96 
 
 		 309 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  33.68 
 
 		 316 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0858  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  157  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  33.45 
 
 		 372 aa  157  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  31.41 
 
 		 318 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  29.91 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  33.96 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  33.96 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  33.96 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  33.08 
 
 		 319 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  33.33 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  33.96 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  33.96 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  33.46 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0609  putative radical SAM protein  32.87 
 
 		 331 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.165086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  33.96 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  33.96 
 
 		 309 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  33.96 
 
 		 320 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  33.08 
 
 		 309 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  33.08 
 
 		 309 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  31.51 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  33.08 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  33.08 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1005  hypothetical protein  32.76 
 
 		 325 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  30.69 
 
 		 318 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  32.7 
 
 		 317 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  31.7 
 
 		 351 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>