208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1565 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  100 
 
 		 300 aa  610  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  66.78 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  60.41 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  60.41 
 
 		 303 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  52.19 
 
 		 317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  52.38 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  51.19 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  50.51 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  49.83 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  46.23 
 
 		 314 aa  267  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11990  radical SAM protein, TIGR01212 family  47.12 
 
 		 318 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000013437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0890  hypothetical protein  45.24 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.896383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  37.46 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  36.7 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  37.63 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0408  putative radical SAM protein  41.03 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  38.1 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  38.1 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  37.97 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  36.39 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  38.89 
 
 		 307 aa  218  8.999999999999998e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  37.29 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  37.04 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  35.84 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  37.25 
 
 		 321 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  37.8 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  36.77 
 
 		 319 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  36.77 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  34.58 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  34.48 
 
 		 318 aa  205  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  34.69 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  34.83 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  34.24 
 
 		 313 aa  201  9e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  33.9 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0609  putative radical SAM protein  33.78 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.165086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  34.14 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  34.95 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  35.52 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  38.36 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  37.45 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  34.8 
 
 		 312 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  37.45 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  34.6 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  34.6 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  34.83 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  34.48 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  34.48 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  37.63 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  34.48 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  34.83 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  34.26 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  36.7 
 
 		 309 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  34.48 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  34.14 
 
 		 319 aa  195  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  34.35 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  37.08 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  36.7 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  36.7 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  37.08 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  36.33 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  34.8 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  36.33 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1403  hypothetical protein  37.72 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0317074  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  33.56 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  35.94 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  33.11 
 
 		 372 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  36.12 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  35.71 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  33.92 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1815  hypothetical protein  31.97 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.501711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1850  hypothetical protein  31.97 
 
 		 317 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013981  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  36.7 
 
 		 341 aa  186  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3355  hypothetical protein  31.7 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.378299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  31.6 
 
 		 316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  33.56 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  30.36 
 
 		 334 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  31.56 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  30.9 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  30.9 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  34.69 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1401  hypothetical protein  32.54 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  35.03 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  30.94 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  29.3 
 
 		 368 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  30.9 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  30.14 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  31.44 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  31.21 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  31.44 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  30 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  30 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  30 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  30 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  30 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  30 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  29.63 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  33.9 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  29.67 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  30.39 
 
 		 312 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>