192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0408 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0408  putative radical SAM protein  100 
 
 		 313 aa  648    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  48.51 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  48.51 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  50.16 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  45.16 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  46.73 
 
 		 320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1815  hypothetical protein  46.03 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.501711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1850  hypothetical protein  46.03 
 
 		 317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  47.18 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  47.18 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  47.18 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  46.84 
 
 		 319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  47.51 
 
 		 319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  46.84 
 
 		 319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  46.84 
 
 		 319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  46.84 
 
 		 319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  46.84 
 
 		 319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  46.51 
 
 		 319 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  46.84 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  45.31 
 
 		 316 aa  279  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  43.23 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  43.56 
 
 		 310 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  43.48 
 
 		 311 aa  272  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  43.93 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  44.44 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  39.47 
 
 		 311 aa  268  8e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  41.86 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  42.19 
 
 		 313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1401  hypothetical protein  41.25 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1403  hypothetical protein  42.3 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0317074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0609  putative radical SAM protein  43.14 
 
 		 331 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.165086  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  40.59 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  39.8 
 
 		 305 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  40 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  40.94 
 
 		 307 aa  235  6e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  39.4 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  40.13 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  36.58 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  39.8 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  37.46 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  37.04 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  37.21 
 
 		 318 aa  225  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  38.11 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  37.92 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  35.39 
 
 		 325 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  36.27 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  41.03 
 
 		 300 aa  222  7e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  36.09 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  34.9 
 
 		 319 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  37.28 
 
 		 314 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  35.45 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  37.92 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  37.58 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  37.23 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  36.39 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  34.56 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  34.55 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  34.56 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  34.55 
 
 		 372 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  37.94 
 
 		 320 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  37.76 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  37.94 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  37.94 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  37.94 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  32.39 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  37.76 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  37.64 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  37.94 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  37.94 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  37.94 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  37.94 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  36.24 
 
 		 319 aa  208  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  35.12 
 
 		 318 aa  208  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  37.76 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  36.9 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  37.59 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  38.36 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3522  radical SAM protein, TIGR01212 family  37.94 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.998452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3627  hypothetical protein  37.23 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3520  radical SAM protein, TIGR01212 family  37.23 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  35.86 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3355  hypothetical protein  34.55 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.378299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3689  hypothetical protein  37.23 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3591  hypothetical protein  37.23 
 
 		 309 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  36 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  37.92 
 
 		 328 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  35.45 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  36.86 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  33.67 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  35.79 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  34.56 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  35.05 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  35.27 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1005  hypothetical protein  35.64 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  34.93 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1137  putative radical SAM protein  35.74 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00496914  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  34.71 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1223  putative radical SAM protein  35.62 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1256  putative radical SAM protein  35.27 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0785555  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  35.76 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>