86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1581 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  668    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  71.89 
 
 		 340 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  71.01 
 
 		 340 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  69.82 
 
 		 340 aa  474  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  54.12 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  38.79 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  31.67 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  31.67 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  27.76 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  29.6 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  32.14 
 
 		 294 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  29.86 
 
 		 301 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  32.16 
 
 		 500 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  28.36 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  30.72 
 
 		 297 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  31.77 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  29.45 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  28.25 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  29.09 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  26.33 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  26.69 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  28.92 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  29.93 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.34 
 
 		 678 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.79 
 
 		 679 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  25.63 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  26.74 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  25.34 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  25.32 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2402  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.17 
 
 		 726 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.66 
 
 		 657 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  24.9 
 
 		 564 aa  55.8  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.79 
 
 		 677 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  23.56 
 
 		 223 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  23.35 
 
 		 230 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  34.18 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  26.64 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  25.69 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  24 
 
 		 226 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  25.33 
 
 		 220 aa  50.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  32.91 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  21.7 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  31.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  30.68 
 
 		 227 aa  49.3  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  32.91 
 
 		 230 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.81 
 
 		 654 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.79 
 
 		 655 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.31 
 
 		 668 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.14 
 
 		 672 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  22.01 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  24.4 
 
 		 226 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.46 
 
 		 657 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1751  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.81 
 
 		 654 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3963  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  32.81 
 
 		 654 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.94523  normal  0.0279642 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.52 
 
 		 708 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.77 
 
 		 668 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.77 
 
 		 668 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.77 
 
 		 668 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.77 
 
 		 668 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.52 
 
 		 708 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  25.49 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.17 
 
 		 672 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.41 
 
 		 666 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350397 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2732  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.41 
 
 		 666 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.41 
 
 		 666 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2608  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.41 
 
 		 666 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  29.23 
 
 		 668 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  29.23 
 
 		 668 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  29.23 
 
 		 668 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1359  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.69 
 
 		 657 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490609  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.64 
 
 		 676 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.23 
 
 		 668 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.96 
 
 		 667 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2568  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.41 
 
 		 666 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.580805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1628  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.81 
 
 		 711 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21 
 
 		 657 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0217  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.81 
 
 		 660 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2914  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.81 
 
 		 660 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.81 
 
 		 711 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2973  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.81 
 
 		 711 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.64 
 
 		 654 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  25.84 
 
 		 617 aa  43.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.67 
 
 		 660 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.32 
 
 		 644 aa  42.7  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19400  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.85 
 
 		 654 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>