143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3463 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  59.87 
 
 		 298 aa  311  9e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  54.64 
 
 		 300 aa  311  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  53.47 
 
 		 289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  54.85 
 
 		 303 aa  302  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  52.78 
 
 		 289 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  53.72 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  41.03 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  38.05 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  37.71 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  38.59 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  39.66 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  40.07 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  36.52 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  36.18 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  35.84 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  27.78 
 
 		 500 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  38.6 
 
 		 187 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  30.08 
 
 		 254 aa  103  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  25.52 
 
 		 366 aa  90.5  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.93 
 
 		 672 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  28.57 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  29.61 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  26.35 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  26 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  29.61 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.09 
 
 		 657 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1926  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  27.62 
 
 		 639 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1796  hypothetical protein  27.62 
 
 		 639 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.94 
 
 		 672 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  32.13 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 564 aa  77  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  26.89 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2054  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  27.9 
 
 		 655 aa  72.4  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2424  hypothetical protein  27.62 
 
 		 637 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.5 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  29.24 
 
 		 635 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  22.84 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.57 
 
 		 657 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  26.29 
 
 		 230 aa  67  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.75 
 
 		 655 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  26.4 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  24.88 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  29.81 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1076  protein of unknown function DUF752  27.36 
 
 		 619 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.506712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  28.35 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.57 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  23.33 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  25.94 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  27.6 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2983  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  26.22 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  27.08 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.82 
 
 		 644 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  21.05 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  28.22 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  23.47 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.56 
 
 		 665 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.17 
 
 		 708 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.17 
 
 		 708 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  26.82 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.83 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2914  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.78 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0217  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.78 
 
 		 660 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19400  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.01 
 
 		 654 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  26.15 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1628  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.78 
 
 		 711 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.78 
 
 		 711 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2973  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.78 
 
 		 711 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  23.98 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1378  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.15 
 
 		 668 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  37.5 
 
 		 654 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3653  hypothetical protein  26.7 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3359  hypothetical protein  25.74 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  25 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.19 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2343  hypothetical protein  26.22 
 
 		 637 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.955559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  24.88 
 
 		 653 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1751  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  36.25 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.79 
 
 		 677 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  36.25 
 
 		 654 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3963  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  36.25 
 
 		 654 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.94523  normal  0.0279642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  24.22 
 
 		 699 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1887  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.68 
 
 		 672 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2377  hypothetical protein  23.7 
 
 		 667 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1390  hypothetical protein  25 
 
 		 622 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.27 
 
 		 676 aa  55.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1170  hypothetical protein  26.7 
 
 		 631 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.285143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4644  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  25 
 
 		 645 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683342  hitchhiker  0.0000257745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1861  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  24.4 
 
 		 661 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1494  hypothetical protein  21.85 
 
 		 666 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0743  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  24.78 
 
 		 668 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1489  hypothetical protein  21.94 
 
 		 666 aa  53.5  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3230  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  34.21 
 
 		 657 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.96 
 
 		 678 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.43 
 
 		 656 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3932  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.77 
 
 		 656 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3401  hypothetical protein  23.19 
 
 		 674 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.473665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1359  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.67 
 
 		 657 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490609  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  22.93 
 
 		 223 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  25 
 
 		 223 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>