144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5281 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  100 
 
 
293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  65.02 
 
 
289 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  64.66 
 
 
289 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  60.21 
 
 
300 aa  352  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  59.93 
 
 
303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  53.72 
 
 
296 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  50.34 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  40.69 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  39.87 
 
 
330 aa  183  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  36.12 
 
 
298 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  38.62 
 
 
301 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  36.12 
 
 
298 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  37.67 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  36.9 
 
 
294 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  36.55 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  35.29 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  31.17 
 
 
500 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  36.26 
 
 
187 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  31.78 
 
 
254 aa  106  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  28.36 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  26.87 
 
 
340 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  27.47 
 
 
340 aa  92.4  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  26.43 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  27.07 
 
 
366 aa  89.4  7e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.78 
 
 
657 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  29.49 
 
 
672 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.63 
 
 
672 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
564 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  27.27 
 
 
653 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  31.78 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  30.36 
 
 
229 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1926  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  26.99 
 
 
639 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1796  hypothetical protein  26.99 
 
 
639 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.9 
 
 
644 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.59 
 
 
666 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.78 
 
 
668 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.1 
 
 
678 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  28.97 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.76 
 
 
679 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  28.57 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2732  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.16 
 
 
666 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2608  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.59 
 
 
666 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  25.47 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1378  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.92 
 
 
668 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.5 
 
 
668 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  27.27 
 
 
668 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  27.27 
 
 
668 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02209  hypothetical protein  27.27 
 
 
668 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.334228  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  23.83 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2475  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.27 
 
 
668 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2619  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.41 
 
 
668 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.27 
 
 
668 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.27 
 
 
668 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3653  hypothetical protein  27.93 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  22.12 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  26.82 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  30.2 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2424  hypothetical protein  25.19 
 
 
637 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2872  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.35 
 
 
666 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  0.0703666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.72 
 
 
666 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000350397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  26.36 
 
 
266 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3369  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.66 
 
 
673 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00235092  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2568  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.29 
 
 
666 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.580805  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2806  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.32 
 
 
675 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.641074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2983  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  24.4 
 
 
620 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2343  hypothetical protein  26.09 
 
 
637 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.955559  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3359  hypothetical protein  28.5 
 
 
219 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  41.67 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1458  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.56 
 
 
675 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1887  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.89 
 
 
672 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2054  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  24.52 
 
 
655 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.11 
 
 
655 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  25.48 
 
 
226 aa  62.4  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  25.5 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  27.27 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.88 
 
 
644 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.83 
 
 
659 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  39.77 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  26.58 
 
 
225 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  24.66 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4644  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  23.83 
 
 
645 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683342  hitchhiker  0.0000257745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  33.9 
 
 
660 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  20.87 
 
 
221 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2586  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.89 
 
 
675 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  27.49 
 
 
223 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  25.74 
 
 
227 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3230  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.62 
 
 
657 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1410  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.47 
 
 
689 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000203784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0372  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.47 
 
 
689 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000353518  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  28.47 
 
 
689 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  31.62 
 
 
653 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  23.96 
 
 
699 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  33.05 
 
 
665 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  24.65 
 
 
227 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0664  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  35.37 
 
 
676 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0436264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  26.6 
 
 
223 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.81 
 
 
656 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002869  5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme MnmC  27.46 
 
 
672 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.23 
 
 
677 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.56 
 
 
667 aa  54.3  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>