120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_06771 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  68.47 
 
 		 301 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  66.78 
 
 		 303 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  67.47 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  43.24 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  42.91 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  38.87 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  40 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  40.97 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  38.23 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  39.25 
 
 		 289 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  39.25 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  36.52 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  36.59 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  38.41 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  35.29 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10381  hypothetical protein  44.02 
 
 		 187 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  31.71 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  30.77 
 
 		 500 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  30.72 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  29.9 
 
 		 366 aa  89  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1456  hypothetical protein  25.46 
 
 		 225 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.439461  normal  0.0456624 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  27.82 
 
 		 340 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  29.33 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1602  protein of unknown function DUF752  27.1 
 
 		 220 aa  79  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  26.88 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  26.61 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0640  hypothetical protein  28.25 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000640329  normal  0.493062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0140  hypothetical protein  25.74 
 
 		 218 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.946459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1235  protein of unknown function DUF752  28.78 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.887893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  27.24 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2146  hypothetical protein  25.49 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 564 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2336  hypothetical protein  23.47 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4769  hypothetical protein  25.87 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  25.44 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07050  hypothetical protein  23.53 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0142  hypothetical protein  23.42 
 
 		 242 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3563  protein of unknown function DUF752  25.73 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158975  normal  0.127143 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2539  hypothetical protein  24.89 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0879  hypothetical protein  24.44 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  21.53 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  23.47 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0147  hypothetical protein  23.68 
 
 		 227 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00930427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0152  protein of unknown function DUF752  24.64 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4488  protein of unknown function DUF752  23.36 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0144966  normal  0.226664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3099  hypothetical protein  25.46 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1277  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.79 
 
 		 667 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0226023  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  22.17 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0621  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.61 
 
 		 612 aa  53.9  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.38 
 
 		 672 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  19.16 
 
 		 657 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.55 
 
 		 657 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.76 
 
 		 665 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2850  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.89 
 
 		 644 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413253  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3653  hypothetical protein  22.38 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0764  hypothetical protein  26.79 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3384  hypothetical protein  23.5 
 
 		 705 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.48 
 
 		 655 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.28 
 
 		 653 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0704  hypothetical protein  25.62 
 
 		 699 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3359  hypothetical protein  29.89 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  20.56 
 
 		 678 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3048  hypothetical protein  34.85 
 
 		 635 aa  48.9  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.0258128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  18.69 
 
 		 656 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1410  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.15 
 
 		 689 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000203784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0372  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.15 
 
 		 689 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000353518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1519  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.15 
 
 		 689 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.36 
 
 		 660 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  18.75 
 
 		 708 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2481  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.08 
 
 		 668 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2891  protein of unknown function DUF752  31.67 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.0591468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1927  hypothetical protein  23.61 
 
 		 617 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  18.75 
 
 		 708 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3401  hypothetical protein  19.7 
 
 		 674 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.473665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3465  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.57 
 
 		 668 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  20.83 
 
 		 679 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002869  5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme MnmC  19.23 
 
 		 672 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1378  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.28 
 
 		 668 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4098  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.77 
 
 		 659 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2914  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  19.91 
 
 		 660 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0217  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  19.91 
 
 		 660 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1628  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  19.91 
 
 		 711 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  19.91 
 
 		 711 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2973  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  19.91 
 
 		 711 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  19.4 
 
 		 657 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1956  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  30.86 
 
 		 644 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1926  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  21.8 
 
 		 639 aa  45.8  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1332  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  21.08 
 
 		 668 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2508  hypothetical protein  39.29 
 
 		 261 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0190771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2702  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.08 
 
 		 668 aa  45.8  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.673186  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1996  fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming enzyme methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme  28.57 
 
 		 690 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.155036  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1796  hypothetical protein  21.8 
 
 		 639 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.48 
 
 		 654 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02249  hypothetical protein  21.08 
 
 		 668 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.425785  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3963  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  20.49 
 
 		 654 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.94523  normal  0.0279642 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1328  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.08 
 
 		 668 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.831924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1359  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  19.9 
 
 		 657 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490609  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.67 
 
 		 672 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>