209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0757 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  100 
 
 		 500 aa  1008    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  35.69 
 
 		 273 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  34.94 
 
 		 278 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  35.56 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  34.81 
 
 		 275 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  35.69 
 
 		 273 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  35.32 
 
 		 273 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1778  hypothetical protein  30.16 
 
 		 303 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773906  normal  0.904742 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0840  protein of unknown function DUF752  31.58 
 
 		 289 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0811  protein of unknown function DUF752  31.58 
 
 		 289 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0559  hypothetical protein  32.32 
 
 		 300 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5281  protein of unknown function DUF752  31.17 
 
 		 293 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.338387 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  31.58 
 
 		 286 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3463  protein of unknown function DUF752  27.78 
 
 		 296 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0679006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  29.86 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  30.15 
 
 		 284 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  32.23 
 
 		 275 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  26.28 
 
 		 292 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  29.96 
 
 		 275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1933  hypothetical protein  29.67 
 
 		 254 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  30.48 
 
 		 278 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  31.11 
 
 		 285 aa  116  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  26.56 
 
 		 289 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  35.14 
 
 		 253 aa  114  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  30.74 
 
 		 275 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  27.13 
 
 		 296 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  29 
 
 		 294 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1941  hypothetical protein  27.6 
 
 		 298 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  28.57 
 
 		 281 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  31.4 
 
 		 271 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  26.19 
 
 		 278 aa  106  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  29.55 
 
 		 246 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  30 
 
 		 282 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  27.14 
 
 		 284 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  30.95 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  35.16 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  33.81 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  25.57 
 
 		 282 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 241 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06771  hypothetical protein  30.77 
 
 		 297 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06381  hypothetical protein  30 
 
 		 303 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0612  hypothetical protein  30.32 
 
 		 301 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  26.84 
 
 		 280 aa  96.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0476  protein of unknown function DUF752  30.45 
 
 		 296 aa  95.5  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  32.63 
 
 		 271 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1581  hypothetical protein  32.16 
 
 		 338 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  26.69 
 
 		 304 aa  94  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  32.37 
 
 		 283 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1130  hypothetical protein  27.62 
 
 		 305 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.398385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  26.69 
 
 		 283 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1833  protein of unknown function DUF752  28.27 
 
 		 229 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.253186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18881  hypothetical protein  27.27 
 
 		 313 aa  91.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.299649 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06691  hypothetical protein  29.55 
 
 		 298 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  33.13 
 
 		 270 aa  90.1  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1327  hypothetical protein  25.94 
 
 		 330 aa  90.1  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2432  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.79 
 
 		 678 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  27.86 
 
 		 274 aa  90.1  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0048  SAM-dependent methyltransferase  29.73 
 
 		 298 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.62416  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1730  hypothetical protein  32.83 
 
 		 340 aa  88.6  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.8235 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06681  hypothetical protein  28.7 
 
 		 294 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245122  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0181  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  87  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2519  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.79 
 
 		 679 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0147  hypothetical protein  30.26 
 
 		 366 aa  87  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.464612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3742  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.76 
 
 		 665 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0063824 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0743  tRNA U-34 5-methylaminomethyl-2-thiouridine biosynthesis protein MnmC  30.26 
 
 		 668 aa  84.7  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  27.39 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3066  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.29 
 
 		 655 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3396  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.34 
 
 		 708 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.34 
 
 		 708 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0873  hypothetical protein  32 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.197999  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  28.64 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3230  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.55 
 
 		 657 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  26.25 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1709  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.97 
 
 		 657 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4505  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.91 
 
 		 656 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1628  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.61 
 
 		 711 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0003  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.61 
 
 		 711 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2973  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.61 
 
 		 711 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2914  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.61 
 
 		 660 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0217  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.61 
 
 		 660 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1538  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.93 
 
 		 672 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0998844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34940  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  26.32 
 
 		 653 aa  79.7  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3871  protein of unknown function DUF752  26.03 
 
 		 226 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0261  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1887  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.7 
 
 		 672 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0067  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  23.87 
 
 		 657 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1871  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.43 
 
 		 672 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0302238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4256  hypothetical protein  25.7 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000473463  hitchhiker  0.0000809329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1639  oxidoreductase, FAD-binding protein  24.19 
 
 		 660 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.562541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1737  hypothetical protein  27.31 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3321  hypothetical protein  25.81 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  31.44 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1671  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.55 
 
 		 654 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1359  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  22.59 
 
 		 657 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.490609  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1964  hypothetical protein  24.56 
 
 		 653 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1378  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  25.24 
 
 		 668 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19400  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  24.89 
 
 		 654 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0825831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 		 625 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1343  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.76 
 
 		 654 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3963  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  21.85 
 
 		 654 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.94523  normal  0.0279642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>