62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1227 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  73.29 
 
 
283 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  72.92 
 
 
304 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  63.1 
 
 
289 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  60.89 
 
 
292 aa  312  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  59.39 
 
 
296 aa  308  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  64.62 
 
 
280 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  42.34 
 
 
275 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  39.58 
 
 
283 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  36.63 
 
 
274 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  38.64 
 
 
285 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  32.61 
 
 
284 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  35.5 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  37.45 
 
 
291 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  33.21 
 
 
273 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  36.63 
 
 
294 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  33.72 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  32.95 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  33.45 
 
 
275 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  33.21 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  33.46 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  35.16 
 
 
282 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  34.69 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  31.4 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  31.2 
 
 
275 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  34.72 
 
 
284 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  32.1 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  28.89 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  34.87 
 
 
271 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  35.48 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  36.07 
 
 
278 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  25.57 
 
 
500 aa  103  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  31.52 
 
 
281 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  27.13 
 
 
246 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  32.33 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 
626 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  32.86 
 
 
626 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 
626 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  32.95 
 
 
270 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  32.23 
 
 
625 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  29.76 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 
241 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  22.64 
 
 
245 aa  60.1  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  24.02 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  26.47 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  28.52 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  27.54 
 
 
245 aa  52.4  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  22.39 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  27.32 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  27.32 
 
 
223 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  28.99 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  27.32 
 
 
223 aa  48.9  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  30.2 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  27.35 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  21.54 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1187  protein of unknown function DUF191  32.76 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  27.69 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  24.79 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  24.58 
 
 
280 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  25.47 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1032  periplasmic solute-binding protein-like protein  25.5 
 
 
278 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>