15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1032 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1032  periplasmic solute-binding protein-like protein  100 
 
 		 278 aa  555  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  31.01 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  25.09 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  23.35 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  26.71 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  30.95 
 
 		 626 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  25.43 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 625 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  23.78 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  25.16 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  23.62 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  26.62 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 626 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>