57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8062 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  100 
 
 		 296 aa  598  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  64.68 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  67.06 
 
 		 283 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  60.53 
 
 		 280 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  60.16 
 
 		 282 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  59.62 
 
 		 292 aa  298  6e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  55.96 
 
 		 289 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  44 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  34.38 
 
 		 284 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  37.66 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  37.22 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  33.58 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  31.27 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  35.06 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  32.86 
 
 		 291 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  30.48 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  35.13 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  33.46 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  29.85 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  31.79 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  32.73 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  29.2 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  31.64 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  30.2 
 
 		 278 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  30.29 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  29.6 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  30.53 
 
 		 282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  28.73 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  27.13 
 
 		 500 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  33.87 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  30.83 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  29.23 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  25.48 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  31.62 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  33.09 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 625 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  29.89 
 
 		 626 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 		 626 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 626 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  27.44 
 
 		 281 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  31.09 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  27.86 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  24.44 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  21.29 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1032  periplasmic solute-binding protein-like protein  30.06 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  25.78 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  20.97 
 
 		 227 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  25.33 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  25.89 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  24.14 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  23.92 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  25.33 
 
 		 223 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  28.07 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  23.02 
 
 		 280 aa  45.8  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  24.38 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  26.29 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>