73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1988 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  56.36 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3445  hypothetical protein  50.55 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  50.55 
 
 		 271 aa  265  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  51.31 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1444  hypothetical protein  45.52 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111813 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0535  hypothetical protein  47.01 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.766739  normal  0.0869709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0462  hypothetical protein  46.27 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.104402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0830  hypothetical protein  44.57 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1815  hypothetical protein  43.01 
 
 		 279 aa  222  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0746  hypothetical protein  42.48 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.227567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3380  hypothetical protein  40.75 
 
 		 281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0613  protein of unknown function DUF191  39.63 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6811699999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0686  hypothetical protein  39.62 
 
 		 277 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  42.05 
 
 		 280 aa  208  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0599  protein of unknown function DUF191  39.41 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000197308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0454  hypothetical protein  40 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3279  hypothetical protein  37.27 
 
 		 284 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  37.74 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1608  hypothetical protein  42.21 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.384595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1187  protein of unknown function DUF191  40.38 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195086 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0552  hypothetical protein  39.1 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1277  hypothetical protein  33.82 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  39.53 
 
 		 279 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  34.38 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4152  protein of unknown function DUF191  34.07 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  35.29 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5858  hypothetical protein  34.7 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  34.7 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  38.87 
 
 		 276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4199  protein of unknown function DUF191  36.96 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1615  hypothetical protein  35.69 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0260  hypothetical protein  35.59 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2176  hypothetical protein  35.69 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1278  protein of unknown function DUF191  35.66 
 
 		 285 aa  158  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0151  hypothetical protein  38.24 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0137772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1773  protein of unknown function DUF191  34.9 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1702  protein of unknown function DUF191  34.51 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3946  hypothetical protein  33.45 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4337  hypothetical protein  33.68 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4422  hypothetical protein  37.64 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928924  normal  0.490091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3234  hypothetical protein  32 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8091  protein of unknown function DUF191  32.7 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3010  protein of unknown function DUF191  33.46 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2098  S-ribosylhomocysteine lyase (autoinducer-2 productionprotein LuxS; AI-2 synthesis protein)  31.36 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.19682  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0620  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha (succinyl-CoA synthetase subunit alpha) (SCS-alpha)  31.21 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2237  protein of unknown function DUF191  32.65 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2413  protein of unknown function DUF191  32.05 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113534 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0202  hypothetical protein  31.48 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1670  hypothetical protein  30.97 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1846  hypothetical protein  30.6 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0340  hypothetical protein  30.11 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0533  hypothetical protein  29.8 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2048  hypothetical protein  30.37 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.343897  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0154  conserved hypothetical protein (DUF191 domain protein)  31.09 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2004  hypothetical protein  32.25 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0715126  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0049  protein of unknown function DUF191  26.25 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  26.94 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0779  periplasmic solute-binding protein-like protein  22.75 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.124322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  31.01 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  27.33 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  26.7 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  26.24 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  25.6 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  25.24 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  24.82 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  25.18 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  29.88 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  31.58 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  23.89 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  24.13 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  26.29 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>