46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0237 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  66.52 
 
 		 232 aa  296  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  65.14 
 
 		 230 aa  281  6.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  63.35 
 
 		 227 aa  281  7.000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  56.05 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  58.88 
 
 		 221 aa  231  5e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  53.12 
 
 		 223 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  53.57 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  53.12 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  47.69 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  26.74 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  29.05 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  28.02 
 
 		 278 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  26.74 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  25.93 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  26.64 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  25.86 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  29.44 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  23.83 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  25.87 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  27.41 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  22.4 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  22.05 
 
 		 283 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  27.62 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  26.07 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  24.05 
 
 		 284 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  20.08 
 
 		 304 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  23.68 
 
 		 298 aa  52  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  20.97 
 
 		 296 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  29.89 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  23.46 
 
 		 294 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  22.55 
 
 		 626 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  22.55 
 
 		 626 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  28.9 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  22.66 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  24.17 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  22.18 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  26.34 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 625 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  27.42 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1277  hypothetical protein  25.47 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  29.21 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  25.47 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  24.75 
 
 		 271 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  24.26 
 
 		 271 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>