38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0346 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  65.62 
 
 		 232 aa  298  3e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  65.62 
 
 		 227 aa  288  5.0000000000000004e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  65.14 
 
 		 227 aa  281  6.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  53.85 
 
 		 221 aa  233  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  51.12 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  51.57 
 
 		 223 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  51.12 
 
 		 223 aa  221  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  53 
 
 		 221 aa  218  5e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  44.75 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  28 
 
 		 500 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  27.53 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  25.86 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  24.63 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  19.48 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  24.91 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  23.77 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  29.78 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  23.05 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  19.55 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  23.57 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  25.56 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  29.24 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  19.22 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 625 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  25.25 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  21.74 
 
 		 626 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  22.83 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  21.74 
 
 		 626 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  21.74 
 
 		 626 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  24.62 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  23.14 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  28.33 
 
 		 275 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  24.62 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  23.28 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>