62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2017 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  69.49 
 
 		 278 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  60.44 
 
 		 273 aa  341  7e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  60.29 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  60.29 
 
 		 273 aa  338  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  55.13 
 
 		 275 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  47.01 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  42.07 
 
 		 275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  42.55 
 
 		 286 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  37.96 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  37.91 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  33.58 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  35.47 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  35.69 
 
 		 500 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  37.91 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  38.58 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  35.77 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  38.13 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  33.58 
 
 		 296 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  33.21 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  34.93 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  38.35 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  35.17 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  35.87 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  34.87 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  33.72 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  32.85 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  34.75 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  30.77 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  32.81 
 
 		 283 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  33.86 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  37.56 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  30.71 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  30.32 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  29.56 
 
 		 253 aa  99.4  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  36.27 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  33.71 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  30.39 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  27.57 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  28.62 
 
 		 626 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 625 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 626 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  27.86 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  27.45 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  29.28 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  26.74 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  25.86 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  26.69 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  29.57 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  27.91 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  25.57 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  29.9 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  29.9 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  29.9 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  24.33 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  27.87 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  27.94 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  24.73 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0224  hypothetical protein  30.88 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.418253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  29.88 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>