59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2019 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  53.23 
 
 
273 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  55.13 
 
 
273 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  48.13 
 
 
278 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  47.97 
 
 
273 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  47.6 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  46.55 
 
 
275 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  42.28 
 
 
275 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  38.3 
 
 
286 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  35.23 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  37.09 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  34.59 
 
 
283 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  36.13 
 
 
284 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  33.7 
 
 
275 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  35 
 
 
282 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  33.46 
 
 
284 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  35.69 
 
 
285 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  36.64 
 
 
286 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  34.23 
 
 
274 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  36.23 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  30.15 
 
 
278 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  30.29 
 
 
296 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  32.96 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  30.74 
 
 
500 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  31.2 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  31.09 
 
 
280 aa  123  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  29.45 
 
 
292 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  31.06 
 
 
271 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  28 
 
 
289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  30.08 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  31.52 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  28.85 
 
 
283 aa  106  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  29.84 
 
 
246 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  29.25 
 
 
304 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  31.8 
 
 
294 aa  99.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  33.45 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  32.76 
 
 
270 aa  92.8  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  26.33 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  30.81 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 
625 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  28.2 
 
 
626 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 
626 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  26.79 
 
 
626 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  25.1 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  24.11 
 
 
238 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  28.36 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  29.41 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  26.05 
 
 
216 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  29.41 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  29.41 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  25.99 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  29.21 
 
 
227 aa  49.3  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0049  protein of unknown function DUF191  19.37 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  25.42 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0224  hypothetical protein  29.44 
 
 
239 aa  45.4  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.418253  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  26.82 
 
 
227 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  25.67 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>