69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1158 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  44 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  42.34 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  43.66 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  40.51 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  42.91 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  39.71 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  41.11 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  39.42 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  41.73 
 
 		 280 aa  205  8e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  39.56 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  37.87 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  37.41 
 
 		 274 aa  191  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  36.1 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  35.4 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  33.58 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  34.33 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  34.7 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  31.39 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  29.78 
 
 		 286 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  33.7 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  31.16 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  32.96 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  29.7 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  29.62 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  30.71 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  33.97 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  28.18 
 
 		 284 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  29.2 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  29.96 
 
 		 500 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  27.57 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  31.5 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  30.15 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  27.82 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  29.79 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  30.63 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  27.34 
 
 		 626 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 625 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 626 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  35.53 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 626 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  29.71 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  22.13 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  28.34 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  23.85 
 
 		 280 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  23.83 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  26.94 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  27.07 
 
 		 216 aa  53.9  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  20.62 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0746  hypothetical protein  20.64 
 
 		 275 aa  49.3  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.227567 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  21.48 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  26.34 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  24.87 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  22.96 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  22.57 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3445  hypothetical protein  21 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  22.73 
 
 		 279 aa  45.8  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  19.77 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0941  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  25.12 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000993087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3279  hypothetical protein  20.39 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  25.6 
 
 		 227 aa  43.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0535  hypothetical protein  22.81 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.766739  normal  0.0869709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1032  periplasmic solute-binding protein-like protein  25.16 
 
 		 278 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1444  hypothetical protein  22.05 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.111813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>